结论：合同发票是同一家公司，但签了协议委托另一家公司收款，这种做法在法律上是合理的，但需要满足一定的条件并遵循相关法律规定。
一、法律背景与合理性分析
合同相对性原则：
- 合同具有相对性，即合同的权利义务主要约束合同双方当事人。在您描述的情况下，发票的开具方（即合同中的卖方或服务提供方）与实际收款方不一致，但这并不直接违反合同相对性原则，因为收款行为可以通过委托协议进行合法授权。
委托收款协议的合法性：
- 根据《中华人民共和国民法典》中关于委托合同的规定，当事人可以约定由一方委托另一方代为履行合同义务，包括收款行为。因此，只要双方签订了合法有效的委托收款协议，并明确了各自的权利义务，这种做法就是合法的。
税务与发票管理：
- 从税务和发票管理的角度来看，发票的开具应与实际交易相符。在您描述的情况下，虽然收款方与发票开具方不一致，但只要交易真实存在，且委托收款协议能够证明这种不一致性的合理性，税务部门通常不会对此提出异议。然而，为了避免潜在的税务风险，建议确保所有交易记录清晰、完整，并妥善保存相关证据。
二、可能存在的风险与防范措施
合同履行风险：
- 如果委托收款方未能按照约定将款项转交给发票开具方，可能导致发票开具方遭受损失。为防范此类风险，建议在委托收款协议中明确约定违约责任和赔偿机制。
税务合规风险：
- 尽管上述做法在法律上可能是合理的，但税务部门可能对这种不一致性进行审查。为确保税务合规，建议定期与税务部门沟通，了解相关税务政策，并确保所有交易记录符合税务要求。
第三方风险：
- 委托收款方作为第三方，其信用状况和经营能力可能影响款项的安全回收。因此，在选择委托收款方时，应进行充分的尽职调查，确保其具备可靠的信用和经营能力。
三、实际操作建议
签订详细的委托收款协议：
- 协议中应明确约定委托收款的范围、期限、方式、违约责任等条款，以确保双方权益得到充分保障。
保留完整的交易记录：
- 包括合同、发票、委托收款协议、付款凭证等，以备税务部门或其他相关部门审查。
定期与税务部门沟通：
- 了解相关税务政策的变化，确保税务合规，避免不必要的税务风险。
如果您在合同发票与委托收款方面遇到任何具体问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。作为专业律师，我将根据您的具体情况提供针对性的法律解决方案。