签约的是一个公司而收款是另一个公司，这种行为是否合法，需要分情况讨论：
存在合法授权或委托关系：
- 如果签约公司与收款公司之间存在明确的合法授权或委托关系，并且这种关系在合同中得到了体现或者双方有书面的授权文件，那么这种行为是合法的。例如，签约公司可能因为某些原因（如税务筹划、资金管理便利等）委托收款公司代为收取款项，只要这种委托关系合法且明确，就不违反法律规定。
无合法授权或委托关系，但构成表见代理：
- 在某些情况下，即使签约公司与收款公司之间没有明确的合法授权或委托关系，但如果收款公司的行为足以让第三方（如合同相对方）相信其有代理权，并且这种相信是合理的，那么可能构成表见代理。在这种情况下，为了保护善意第三方的利益，法律可能会认定收款行为有效，但签约公司事后可以向收款公司追偿。不过，这种情况较为复杂，且需要满足一定的法律条件。
无合法授权或委托关系，也不构成表见代理：
- 如果签约公司与收款公司之间既没有合法授权或委托关系，也不构成表见代理，那么收款公司的收款行为可能构成无权代理或甚至欺诈。在这种情况下，签约公司有权拒绝承认收款行为，并可能要求收款公司承担法律责任。同时，合同相对方也可能因为收款行为的不合法性而面临风险，如款项被追回、合同无效等。
法律建议：
- 对于签约公司而言，如果确实需要委托其他公司代为收款，应当签订明确的委托合同或授权书，并确保合同相对方知晓并同意这种安排。
- 对于合同相对方而言，在签订合同时应当仔细审查合同条款，特别是关于收款方的约定。如果发现签约公司与收款公司不一致的情况，应当要求签约公司提供合法的授权或委托文件，或者考虑在合同中增加相应的保障条款。
可能的风险与后果：
- 如果收款行为不合法，可能导致合同无效或被撤销，从而给各方带来经济损失和法律风险。
- 在涉及大额交易或复杂商业安排时，不合法的收款行为还可能引发更严重的法律纠纷和监管处罚。
总结：签约的是一个公司而收款是另一个公司是否合法，取决于双方之间是否存在合法授权或委托关系以及是否构成表见代理。为了避免法律风险和经济损失，各方在签订合同时应当谨慎审查合同条款和收款安排，并在必要时寻求专业法律意见。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。