工厂搬迁员工不同意时，员工有权根据具体情况选择是否继续工作或要求补偿，具体分析如下：
工厂搬迁是否构成劳动合同的重大变更：
- 根据《劳动合同法》的相关规定，劳动合同的变更应当遵循平等自愿、协商一致的原则。工厂搬迁，特别是跨地区或显著改变工作地点的搬迁，通常被视为劳动合同内容的重大变更。
- 如果搬迁导致员工的工作条件、生活环境等发生显著变化，且这种变化是员工在签订劳动合同时无法预见的，那么员工有权拒绝搬迁，并可以要求与用人单位协商变更劳动合同或解除劳动合同。
员工不同意搬迁时的权利与选择：
- 继续工作：如果员工选择继续在原工作地点工作，而工厂因搬迁无法提供原工作条件，员工可以要求用人单位按照原劳动合同履行义务，或者要求用人单位支付因无法提供工作条件而造成的损失。
- 解除劳动合同并要求补偿：如果员工因工厂搬迁而选择解除劳动合同，根据《劳动合同法》的规定，员工有权要求用人单位支付经济补偿。经济补偿的标准通常按照员工在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向员工支付半个月工资的经济补偿。
特殊情况下的处理：
- 工厂提供交通补贴或住宿：如果工厂在搬迁后为员工提供了交通补贴、住宿等便利条件，且这些条件能够合理弥补搬迁带来的不便，员工可能需要重新考虑是否接受搬迁。在这种情况下，员工与用人单位可以就新的工作条件进行协商，并达成一致意见。
- 员工拒绝合理搬迁安排：如果工厂的搬迁是合理的，且为员工提供了必要的便利条件，但员工仍然拒绝搬迁，那么用人单位可能有权根据规章制度对员工进行处理，包括解除劳动合同。但在此之前，用人单位应当确保已经与员工进行了充分的沟通和协商，并尽量为员工提供合理的解决方案。
建议与行动步骤：
- 与用人单位沟通：首先，建议员工与用人单位进行沟通，了解搬迁的具体原因、目的以及可能带来的影响。同时，员工可以表达自己的意见和诉求，与用人单位协商解决方案。
- 咨询专业律师：如果员工对搬迁的合法性、经济补偿等问题存在疑问或争议，建议咨询专业律师以获取更详细的法律建议和指导。
- 保留证据：在沟通过程中，员工应当保留好相关证据，如劳动合同、搬迁通知、沟通记录等，以便在需要时维护自己的合法权益。
总结来说，工厂搬迁员工不同意时，员工有权根据具体情况选择是否继续工作或要求补偿。在处理此类问题时，建议员工与用人单位进行充分沟通，并咨询专业律师以获取更详细的法律建议和指导。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。