结论：公司未经员工允许变更公积金和社保基数、比例的行为，通常是不合理且不合法的。以下从不同角度详细分析：

1. 从法律规定角度

   • 社保方面：根据《社会保险法》等相关法律法规，用人单位应当按照国家规定的本单位职工工资总额的比例缴纳基本养老保险费等社会保险费用，职工也需按照规定比例缴纳。社保缴费基数一般应根据职工上一年度月平均工资来确定（有上下限规定）。公司未经员工同意擅自变更社保基数和比例，若变更后的基数低于员工实际工资水平或者不符合当地规定的缴费基数范围，就违反了法律规定，损害了员工的合法权益。例如，员工上一年度月平均工资为8000元，当地规定的社保缴费基数下限为5000元，上限为20000元，公司却擅自将该员工的社保缴费基数调整为4000元，这就明显违法。
   • 公积金方面：《住房公积金管理条例》规定，职工住房公积金的月缴存额为职工本人上一年度月平均工资乘以职工住房公积金缴存比例。单位为职工缴存的住房公积金的月缴存额为职工本人上一年度月平均工资乘以单位住房公积金缴存比例。单位和职工的缴存比例均不得低于职工上一年度月平均工资的5%；有条件的城市，可以适当提高缴存比例。公司未经员工允许变更公积金基数和比例，若不符合上述规定，也是不合法的。比如，员工月平均工资为6000元，公司却将公积金缴存基数调整为3000元，且未与员工协商一致，这就违反了条例规定。

2. 从合同约定角度

   • 员工与公司签订的劳动合同中，一般会明确约定工资待遇、社保和公积金的缴纳等相关事项。如果劳动合同中已经明确规定了社保和公积金的基数和比例，公司未经员工同意擅自变更，就属于违约行为。员工可以依据劳动合同的约定，要求公司按照原约定履行义务，恢复原来的社保和公积金基数和比例。例如，劳动合同中约定公积金缴存比例为职工和单位各12%，公司却擅自降低为5%，员工有权要求公司按照12%的比例缴纳。

3. 从员工权益保护角度

   • 社保和公积金的缴纳直接关系到员工的切身利益。社保包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险，为员工提供了基本的生活保障和医疗保障等。公积金则可以帮助员工解决住房问题。公司未经员工允许变更基数和比例，会降低员工享受的社保待遇和公积金福利。例如，社保缴费基数降低会导致员工退休后领取的养老金减少；公积金缴存比例降低会影响员工购房时的贷款额度和还款能力。员工有权维护自己的合法权益，要求公司停止违法行为。

建议：如果员工遇到公司未经允许变更公积金和社保基数、比例的情况，可以先与公司进行沟通协商，要求公司说明变更的原因并恢复原来的基数和比例。如果协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉，劳动监察部门会依法对公司进行调查处理。也可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，通过法律途径维护自己的合法权益。

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