结论：离职证明上写“严重违反公司制度”这一表述，若与事实不符，您确实有权进行举报或采取其他法律措施来维护自己的权益。
法律背景与依据
离职证明的法律性质：
- 离职证明是用人单位与劳动者解除劳动关系后，由用人单位出具给劳动者的书面证明。它主要用于证明劳动者与原用人单位的劳动关系已经解除或终止，以及劳动者在原用人单位的工作经历。
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第五十条的规定，用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。
离职证明的内容要求：
- 离职证明应当客观、真实地反映劳动者在用人单位的工作情况，包括工作期限、工作岗位、工作表现等。
- 离职证明中不得包含对劳动者不利的不实陈述或诽谤性言论，否则可能构成对劳动者名誉权的侵害。
对不实离职证明的举报与维权：
- 如果离职证明中包含“严重违反公司制度”等不实陈述，且这一陈述与事实不符，那么这一表述就可能构成对劳动者名誉权的侵害。
- 劳动者有权要求用人单位更正离职证明中的不实内容，并有权向相关部门（如劳动监察部门）进行举报，要求用人单位承担相应的法律责任。
具体建议与操作步骤
与用人单位沟通：
- 首先，您可以尝试与用人单位进行沟通，要求其更正离职证明中的不实内容。在沟通过程中，您可以提供相关证据来证明自己的清白和离职证明中的不实之处。
向劳动监察部门举报：
- 如果与用人单位的沟通无果，您可以向当地的劳动监察部门进行举报。在举报时，您需要提供离职证明、相关证据以及您的陈述和诉求。劳动监察部门将会对您的举报进行调查，并根据调查结果作出相应的处理。
考虑法律诉讼：
- 如果劳动监察部门的处理结果未能满足您的诉求，或者您认为用人单位的行为已经严重侵害了您的合法权益，那么您可以考虑通过法律诉讼来维护自己的权益。在诉讼过程中，您需要提供充分的证据来证明离职证明中的不实陈述以及这一陈述对您造成的损害。
可能的法律后果
- 如果用人单位在离职证明中包含不实陈述，且这一陈述被证实为虚假，那么用人单位可能需要承担相应的法律责任，包括更正离职证明、赔偿劳动者因此遭受的损失等。
- 在极端情况下，如果用人单位的行为构成诽谤或侮辱等犯罪行为，那么用人单位还可能面临刑事责任的追究。
最后，我建议您在处理此类问题时保持冷静和理性，通过合法途径来维护自己的权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。