在房屋征迁补偿协议与政府签订后，通常是由政府或其指定的部门来负责付款。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 政府作为付款主体的法律依据：

   • 在房屋征迁过程中，政府作为征收方，与被征收人签订征迁补偿协议是常见的做法。根据相关法律法规，政府有义务按照协议约定的内容和标准，向被征收人支付相应的补偿款项。
   • 政府作为公共利益的代表，在征迁过程中承担着主要的责任和义务，包括确保被征收人的合法权益得到保障，以及按照协议及时支付补偿款项。

2. 政府指定部门付款的情况：

   • 在实际操作中，政府可能会指定其下属的某个部门或机构来负责具体的付款工作。这些部门或机构通常具有专门的财务和支付系统，能够确保补偿款项的及时、准确支付。
   • 政府指定部门付款的做法，有助于提高支付效率，减少支付过程中的繁琐环节，从而更好地保障被征收人的权益。

3. 付款流程与注意事项：

   • 在签订征迁补偿协议后，政府或其指定的部门会按照协议约定的时间和方式，向被征收人支付补偿款项。这通常包括货币补偿、房屋置换补偿等多种形式。
   • 被征收人在收到补偿款项前，应仔细核对协议内容，确保补偿款项的金额、支付方式等与协议约定一致。如有任何疑问或不符，应及时与政府或其指定部门沟通解决。
   • 同时，被征收人应保留好相关证据和文件，如征迁补偿协议、支付凭证等，以备不时之需。

4. 特殊情况下的付款责任：

   • 在某些特殊情况下，如政府因资金问题无法及时支付补偿款项时，被征收人可以通过法律途径维护自己的权益。根据相关法律法规，政府有义务确保被征收人的合法权益得到保障，包括及时支付补偿款项。
   • 如果政府或其指定部门存在违约行为，如未按照协议约定支付补偿款项等，被征收人可以依法向人民法院提起诉讼，要求政府或其指定部门承担相应的法律责任。

建议：在签订房屋征迁补偿协议前，被征收人应充分了解协议内容，确保自己的权益得到充分保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，提供专业的法律意见和帮助。