在综合计算工时工作制下，周末加班是否需要支付加班费，需根据具体情况来判断。以下是对此问题的详细分析：
一、综合计算工时制的定义与特点
综合计算工时工作制是针对因工作性质特殊，需连续作业或受季节及自然条件限制的企业的部分职工，采用的以周、月、季、年等为周期综合计算工作时间的一种工时制度。在综合计算周期内，某一具体日（或周）的实际工作时间可以超过8小时（或40小时），但平均日和周工作时间应与法定标准工作时间基本相同。
二、加班费的支付条件
法定节假日工作：
- 无论劳动者在综合计算周期内的实际工作时间如何，只要在法定节假日提供了劳动，用人单位就必须按照不低于劳动者本人日或小时工资的300%支付加班工资。这一规定是强制性的，且不能以调休或补休来替代。
综合计算周期内工作时间超过法定标准工作时间：
- 在综合计算周期内，如果劳动者的实际工作时间总数超过了该周期的法定标准工作时间总数（如某季度为500小时），那么超出部分应视为延长工作时间。对于这部分超时工作，用人单位应按照不低于劳动者本人小时工资的150%支付加班工资。
- 计算公式：延长工作时间的加班费 = 延长工作小时数 × 小时工资 × 150%。其中，小时工资计算方法为：月工资收入 ÷（月计薪天数21.75天 × 8小时）。
综合计算周期内未超过法定标准工作时间：
- 如果劳动者的实际工作时间总数在综合计算周期内未超过法定标准工作时间总数（即使在某一日或某一周内超过了标准工作时间），则通常不视为加班，用人单位无需支付加班费。例如，以月为计算周期，员工全月累计工作时间未超过166.64小时，则不存在加班情况。
休息日工作的特殊情况：
- 在综合工时制下，如果劳动者在休息日工作，且该休息日并非法定节假日，同时用人单位不能安排补休的，一般应按照不低于本人日或小时工资标准的200%（部分地区或行业可能有特殊规定，如按照150%计算，但需以当地规定为准）计算加班费。不过，由于综合计算工时制已经考虑了休息日的因素，在多数情况下，休息日工作并不直接视为加班，除非该休息日的工作导致了综合计算周期内总工作时间的超标。
三、实际案例与说明
假设某员工实行以月为周期的综合计算工时制，其月工资为5000元。在某个月中，该员工实际工作了180小时，而该月的法定标准工作时间为166.64小时。那么，该员工超出的工作时间为13.36小时。对于这超出的13.36小时，用人单位应按照不低于该员工小时工资的150%支付加班费。具体计算如下：
- 小时工资 = 5000元 ÷（21.75天 × 8小时）= 28.74元/小时
- 加班费 = 13.36小时 × 28.74元/小时 × 150% = 574.86元
四、建议与注意事项
- 了解当地规定：由于各地对于综合工时制的具体规定和操作可能存在差异，因此在实施时应参照当地法律法规和政策执行。
- 保留工作记录：劳动者应保留好自己在综合计算周期内的工作记录，以便在需要时证明自己的工作时间和加班情况。
- 及时沟通：如果劳动者对自己的加班费有疑问或认为用人单位未按规定支付加班费，应及时与用人单位沟通或向相关部门投诉。
综上所述，综合计算工时制下的周末加班是否需要支付加班费，取决于劳动者在综合计算周期内的实际工作时间是否超过了法定标准工作时间以及是否在法定节假日工作。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。