核心结论：针对承包设施用地建了牛棚后被他人承包的情况，需根据土地性质、承包合同约定、牛棚建设合法性等多方面因素综合判断处理方式，以下分情况说明：

1. 若土地性质为农业用地且承包合同有明确约定

• 合同效力优先：若原承包合同明确约定土地用途为畜牧业（如养牛），且您在承包期内依法建设牛棚，则他人无权擅自承包该土地。您可依据《民法典》合同编，主张原承包合同继续有效，要求对方停止侵害、恢复原状或赔偿损失。
• 关键证据：需提供承包合同、土地用途审批文件、牛棚建设许可（如乡村建设规划许可证）等证据，证明您的承包权及建设行为的合法性。

2. 若土地性质为非农业用地或承包合同未明确约定用途

• 土地性质决定权利：若土地实际为建设用地（如集体经营性建设用地），且您未依法办理用地审批手续，牛棚可能被认定为违法建筑。此时，他人通过合法程序承包土地后，您可能面临牛棚被拆除或土地被收回的风险。
• 补救措施：若土地性质可调整为农业用途，您可尝试申请补办用地手续；若无法补办，建议与新承包人协商补偿或拆除牛棚，避免扩大损失。

3. 若他人承包行为存在程序瑕疵

• 挑战承包合法性：若新承包人未通过公开招标、拍卖或协商等法定程序取得承包权（如村集体私下发包），您可依据《农村土地承包法》向乡镇政府或农业农村部门投诉，要求撤销承包合同。
• 行政救济途径：收集新承包人未履行法定程序的证据（如未公示、未签订书面合同等），向相关部门申请行政复议或提起行政诉讼。

4. 若涉及第三方侵权（如村集体擅自转包）

• 追究违约责任：若村集体在您承包期内未经同意将土地转包他人，构成违约。您可依据承包合同要求村集体承担违约责任，并主张继续履行原合同。
• 集体成员权保护：若您为村集体成员，可依据《村民委员会组织法》参与村民会议，对土地承包方案提出异议，维护自身权益。

行动建议

1. 立即固定证据：收集承包合同、土地权属证明、牛棚建设审批文件、新承包人信息等材料。
2. 协商优先：尝试与新承包人、村集体协商，明确土地使用权归属及补偿方案。
3. 法律程序：若协商无果，根据具体情况选择行政投诉、民事诉讼或仲裁等途径解决争议。

提示：土地承包纠纷涉及行政、民事交叉法律问题，建议根据具体案情制定策略。如有进一步疑问，可直接向我咨询，我将结合证据材料提供详细解决方案。