民营医院科室被关停，职工的补偿情况需根据具体情形来确定，主要包括经济补偿金和可能的赔偿金两种情况。以下是对此问题的详细分析：
一、经济补偿金
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十六条，有下列情形之一的，用人单位应当向劳动者支付经济补偿：…（六）依照本法第四十四条第四项、第五项规定终止劳动合同的；…。其中，第四十四条第四项指的是用人单位被依法宣告破产的，第五项指的是用人单位被吊销营业执照、责令关闭、撤销或者用人单位决定提前解散的。虽然科室关停并不直接等同于医院破产或关闭，但若科室关停导致劳动合同无法继续履行，且医院无法为职工提供其他合适岗位，则可能构成劳动合同法规定的支付经济补偿金的情形。
- 此外，如果医院与职工协商一致解除劳动合同，根据《劳动合同法》第三十六条和第四十六条，医院也需支付经济补偿金。
计算方式：
- 经济补偿金的标准按照劳动者在本单位工作的年限，以每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
- 这里的月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
计算公式：\(经济补偿金 = 工作年限 \times 月工资\)（工作年限不足一年的按比例计算）
- 示例：
- 假设某职工在医院工作了3年6个月，月工资为5000元，因科室关停导致劳动合同解除，则医院应支付的经济补偿金为：\(3.5年 \times 5000元/月 = 17500元\)。
二、赔偿金
适用情形：
- 如果医院未经合法程序（如未与职工协商一致、未提前通知等）就单方面解除劳动合同，且职工不存在过错，那么医院可能构成违法解除劳动合同，需要支付赔偿金。
计算方式：
计算公式：\(赔偿金 = 2 \times 经济补偿金\)
- 示例：
- 继续使用上面的例子，如果医院违法解除劳动合同，则应支付的赔偿金为：\(2 \times 17500元 = 35000元\)。
三、其他注意事项
协商与调解：
- 在科室关停的情况下，医院应首先与职工进行协商，尽量达成一致的解决方案。如果协商不成，可以寻求劳动调解委员会的帮助进行调解。
劳动仲裁与诉讼：
- 如果调解不成，职工可以向劳动仲裁委员会申请仲裁，对仲裁结果不服的，还可以向人民法院提起诉讼。
证据收集：
- 职工在维权过程中应注意收集相关证据，如劳动合同、工资单、工作证明、科室关停的通知等，以便在仲裁或诉讼中证明自己的权益。
总结来说，民营医院科室被关停时，职工的补偿情况需根据具体情形来确定。如果医院合法解除劳动合同，应支付经济补偿金；如果医院违法解除劳动合同，则应支付赔偿金。职工在维权过程中应注意收集证据，并可以通过协商、调解、仲裁或诉讼等途径来维护自己的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。