结论：分居期间男方到女方工作单位影响女方工作的，女方可以报警。
详细分析：
法律背景：
- 根据《中华人民共和国治安管理处罚法》的相关规定，对于干扰他人正常生活、工作的行为，如纠缠、骚扰等，公安机关有权依法进行处罚。这包括但不限于警告、罚款、拘留等措施。
- 在婚姻关系存续期间或分居期间，任何一方都不得侵犯另一方的合法权益，包括工作权、人身自由权等。男方到女方工作单位进行骚扰，显然侵犯了女方的工作权和正常生活秩序。
报警的合理性：
- 女方在面临男方到其工作单位进行骚扰，影响其正常工作时，有权向公安机关报警。公安机关会依法进行调查，并根据情况采取相应的措施来制止男方的行为，保护女方的合法权益。
- 报警不仅是对男方行为的制止，也是对女方自身权益的一种保护。通过报警，女方可以留下官方记录，为后续可能的法律诉讼或维权行动提供证据。
可能的法律后果：
- 如果男方的行为构成违法，公安机关将依法对其进行处罚，如警告、罚款或拘留等。
- 如果男方的行为严重到构成犯罪，如寻衅滋事罪等，那么他还可能面临刑事责任的追究。
建议：
- 女方在报警前，可以尽量收集相关证据，如现场照片、视频、证人证言等，以便公安机关更好地了解情况并作出处理。
- 同时，女方也可以考虑向单位领导或人事部门报告此事，寻求单位的支持和帮助，如调整工作岗位、提供安全保护等。
- 如果男方的行为持续不断且严重影响到女方的生活和工作，女方还可以考虑向法院申请人身安全保护令或提起离婚诉讼等法律途径来维护自己的权益。
总结：分居期间男方到女方工作单位影响女方工作的行为是违法的，女方有权报警并寻求法律保护。在处理此类问题时，女方应保持冷静，收集证据，并及时向公安机关或相关单位报告，以维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。