结论：在分居期间，如果男方纠缠女方，女方是可以报警的，但具体处理方式会根据纠缠行为的性质和严重程度有所不同。以下从不同角度为你详细分析：
一、报警的法律依据与合理性
法律依据：
- 根据《中华人民共和国治安管理处罚法》的相关规定，对于干扰他人正常生活的行为，如多次发送淫秽、侮辱、恐吓或者其他信息，干扰他人正常生活的，处五日以下拘留或者五百元以下罚款；情节较重的，处五日以上十日以下拘留，可以并处五百元以下罚款。
- 如果男方的纠缠行为升级为暴力、威胁或其他更严重的违法行为，那么还可能触犯《中华人民共和国刑法》中的相关规定，如故意伤害罪、寻衅滋事罪等。
合理性：
- 报警是维护自身合法权益的一种有效方式。当女方感到自身安全受到威胁或正常生活受到干扰时，及时报警可以寻求警方的帮助和保护。
- 警方会根据具体情况进行调查，并根据相关法律法规对男方进行相应的处理，从而维护女方的合法权益和社会秩序。
二、不同纠缠行为的处理方式
轻微纠缠行为：
- 如果男方的纠缠行为相对轻微，如偶尔的电话骚扰、短信骚扰等，女方可以先尝试通过沟通、警告等方式解决。
- 如果沟通无果，女方可以向警方报案，警方会进行调解或警告男方停止纠缠行为。
严重纠缠行为：
- 如果男方的纠缠行为严重，如多次上门骚扰、跟踪、威胁甚至实施暴力等，女方应立即报警。
- 警方会迅速出警，保护女方的安全，并根据情况对男方采取强制措施，如拘留、罚款等。
- 如果男方的行为构成犯罪，警方还会将其移送检察机关审查起诉，依法追究其刑事责任。
三、报警后的注意事项
保留证据：
- 女方在报警前应尽可能保留男方纠缠行为的证据，如电话记录、短信内容、视频监控等。
- 这些证据将有助于警方调查取证，为处理案件提供有力支持。
配合警方调查：
- 女方在报警后应积极配合警方的调查工作，如实陈述事实，提供相关证据。
- 警方会根据女方的陈述和证据进行调查，并根据情况对男方进行处理。
寻求法律援助：
- 如果女方的权益受到严重侵害，且报警后问题仍未得到解决，女方可以寻求法律援助或咨询专业律师。
- 律师会根据女方的具体情况提供法律建议和支持，帮助女方维护自身合法权益。
建议：在分居期间，如果男方纠缠女方，女方应保持冷静，根据纠缠行为的性质和严重程度选择合适的处理方式。如果感到自身安全受到威胁或正常生活受到严重干扰，应及时报警并寻求警方的帮助和保护。同时，女方也可以咨询专业律师，了解自己的法律权益和维权途径。如果你有进一步的法律问题或需要更具体的法律建议，可以直接向我咨询。