针对您提出的“就业协议朋友盖章后但是不入职档案派遣怎么办”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，需要明确的是，就业协议是毕业生与用人单位之间确立劳动关系和明确双方权利义务的协议。若就业协议已经由朋友代为盖章，但您本人并不打算入职该单位，这实际上构成了一种违约行为（尽管盖章行为本身可能存在争议，但核心问题是您不打算履行协议）。不过，就档案派遣而言，关键在于您的实际就业情况和毕业去向登记。
档案派遣的基本原则
根据就业情况派遣：档案的派遣通常是根据毕业生的实际就业情况来确定的。如果您并未实际入职该单位，那么档案不应被派遣至该单位。
毕业去向登记：教育部门建立了高校毕业生毕业去向登记制度，作为高校为毕业生办理离校手续的必要环节。您应及时完成毕业去向登记，并核实信息后报省级教育部门备案。这是档案派遣的重要依据。
具体操作建议
与盖章单位沟通：
- 首先，您应尽快与盖章的单位取得联系，说明您不打算入职的情况，并请求该单位出具一份书面说明，表明您并未实际入职，且该单位不会接收您的档案。
修改毕业去向登记：
- 登录全国高校毕业生毕业去向登记系统（或相关平台），修改您的毕业去向登记信息，确保档案派遣地址与您的实际就业情况相符。
- 如果您尚未就业，可以选择将档案派遣至户籍地公共就业人才服务机构，或按规定在高校保留两年。
联系高校就业指导中心：
- 告知高校就业指导中心您的实际情况，包括就业协议盖章但未入职的情况，以及您希望档案如何派遣。
- 高校就业指导中心会根据您的实际情况和毕业去向登记信息，指导您完成档案派遣的相关手续。
关注档案派遣进度：
- 在档案派遣过程中，您应保持与高校就业指导中心和档案接收单位的联系，及时了解档案派遣的进度和情况。
- 如果发现档案派遣地址有误或档案未按时到达接收单位，应及时与相关单位沟通并解决问题。
注意事项
- 诚信原则：尽管您可能因各种原因不打算入职盖章的单位，但应秉持诚信原则，及时与该单位沟通并说明情况，避免给对方带来不必要的麻烦。
- 档案重要性：档案是个人成长发展的证明材料，对职称评审、报考公务员和国有企事业单位、入党政审、养老待遇核准等事项都至关重要。因此，您应高度重视档案的派遣和保管问题。
- 法律法规：在处理档案派遣问题时，您应遵守相关法律法规和政策规定，确保自己的权益得到保障。
综上所述，针对您提出的问题，关键在于及时与盖章单位沟通、修改毕业去向登记信息、联系高校就业指导中心并关注档案派遣进度。希望这些建议能对您有所帮助。