合同中约定的“三日”是否指工作日，需根据合同具体条款、交易习惯及法律规定综合判断，无统一答案。以下从不同角度进行分析：

1. 合同条款的明确性
   若合同中明确约定“三日”为“工作日”（如“乙方应在收到通知后三个工作日内回复”），则直接按工作日计算，排除法定节假日和休息日。此类约定具有法律效力，双方需严格遵守。

2. 合同条款的模糊性
   若合同仅写“三日”未明确是否为工作日，则需结合以下因素判断：

   • 交易习惯：若双方此前合作或行业惯例中“日”均指工作日，可推定为工作日；
     
   • 合同目的：若履行期限紧迫（如紧急维修、时效性强的交易），可能倾向于按自然日计算；
     
   • 法律规定：根据《民法典》第一百二十五条，对履行期限约定不明的，可协议补充；不能达成补充协议的，按合同相关条款或交易习惯确定。

3. 法律对特殊情形的规定

   • 劳动工伤领域：若合同涉及劳动仲裁（如工伤认定申请期限），根据《工伤保险条例》第十七条，用人单位需在事故发生后30日内提出申请，此处“日”为自然日，含节假日；
     
   • 诉讼时效：根据《民法典》第一百八十八条，诉讼时效期间为三年，自权利人知道或应当知道权利受损之日起计算，此处“年”为自然年。

4. 实践建议

   • 明确约定：为避免争议，建议在合同中写明“三日”为“工作日”或“自然日”，并列举具体起止时间（如“自收到通知之日起第三个工作日”）；
     
   • 证据留存：若对方未按约定履行，需及时固定证据（如书面催告、邮件记录等），以便后续维权；
     
   • 法律救济：若因期限计算产生纠纷，可依据《民法典》第五百一十条（合同补充解释）或第五百一十一条（履行期限约定不明）主张权利。

总结：合同中“三日”是否为工作日无固定标准，需结合条款、习惯和法律综合判断。建议签订合同时明确期限性质，避免歧义。如有具体合同或纠纷，可直接向我咨询，我将结合案情提供专业分析。