结论：卫生院让员工垫付疫苗款项，员工私对公向疾控中心转账疫苗款的行为，可能涉及违反财务管理规定以及潜在的税务风险，但直接违反的具体法律条款需结合具体情况分析，以下从不同角度进行详细阐述。
一、从财务管理规定角度分析
单位财务管理制度：
- 卫生院作为事业单位或医疗机构，通常会有严格的财务管理制度，要求款项的收支必须通过单位账户进行，以确保资金的安全和合规性。
- 员工私对公转账疫苗款，可能绕过了单位的正常财务流程，违反了单位的财务管理制度。虽然这不一定直接构成违法行为，但可能受到单位内部的纪律处分。
公款私存与挪用公款：
- 如果员工垫付的款项被视为公款（即本应由单位支付的款项），而员工却以个人名义进行垫付并转账，这可能涉及“公款私存”的问题。不过，公款私存通常指的是将公款存入个人账户，而本案例中是私对公转账，情况略有不同，但核心在于款项的性质和流转是否合规。
- 若员工在垫付过程中有挪用单位资金或意图侵占单位财产的行为，则可能构成挪用公款或职务侵占等违法行为，但这需要具体证据支持。
二、从税务风险角度分析
个人所得税与发票管理：
- 员工垫付疫苗款后，如果单位未及时报销或未以合理方式补偿员工，可能导致员工个人承担不必要的经济负担，并可能涉及个人所得税问题。例如，如果单位以奖金或津贴形式补偿员工，这部分收入可能需要缴纳个人所得税。
- 另外，如果员工垫付时未取得正规发票，而单位在报销时要求提供发票，这可能导致员工无法报销或面临税务风险。
单位税务合规性：
- 卫生院作为纳税主体，需要确保其所有经济活动的税务合规性。员工私对公转账疫苗款可能使得单位的财务记录变得不清晰，增加税务审计的风险。
三、法律建议与风险提示
对于员工：
- 在垫付疫苗款前，应与单位明确垫付的性质、金额、报销方式等，并保留好相关证据（如转账记录、垫付说明等）。
- 如果单位未及时报销或补偿，员工应与单位协商解决，必要时可寻求法律援助或向相关部门投诉。
对于卫生院：
- 应建立健全的财务管理制度，明确款项的收支流程和审批权限，避免员工私对公转账等不合规行为的发生。
- 如果确实需要员工垫付款项，应与员工签订书面协议，明确垫付的性质、金额、报销方式等，并及时报销或补偿员工。
四、可能涉及的法律条款（虽不直接对应，但为相关参考）
- 虽然直接的法律条款可能并未明确提及“员工私对公转账疫苗款”的行为，但《中华人民共和国会计法》、《中华人民共和国税收征收管理法》以及相关财务管理规定和税务法规中，均有关于单位财务管理、税务合规性的要求，这些要求间接规范了此类行为。
总结：卫生院让员工垫付疫苗款项，员工私对公向疾控中心转账疫苗款的行为，虽然不一定直接违反某一条具体的法律条款，但可能涉及违反财务管理规定和潜在的税务风险。建议员工和卫生院均应遵守相关法律法规和单位内部管理制度，确保经济活动的合规性和安全性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。