对行政机关签订的补偿协议不满意，一般情况下不能直接申请复查，但可以通过其他合法途径来维护自己的权益。以下是对这一问题的详细分析：
一、复查的适用范围
复查通常适用于对行政机关作出的具体行政行为（如行政处罚、行政强制等）不服的情况。而补偿协议，作为行政机关与当事人之间就补偿事宜达成的协议，其性质更接近于民事合同，而非具体行政行为。因此，直接对补偿协议申请复查并不符合复查的常规适用范围。
二、对补偿协议不满意的合法途径
协商：
- 如果对补偿协议的内容不满意，首先可以尝试与行政机关进行协商，看是否能够达成双方都能接受的修改或补充协议。
行政复议（虽非直接复查，但为合法救济途径）：
- 如果协商无果，且认为行政机关在签订补偿协议过程中存在违法行为或不当行为，可以向上一级行政机关或法律、法规规定的行政机关申请行政复议。行政复议机关将对原行政行为的合法性、适当性进行审查，并作出复议决定。但需要注意的是，行政复议通常针对的是具体行政行为，而非协议本身。不过，在复议过程中，可以就协议签订过程中的行政行为提出异议。
行政诉讼：
- 如果对行政复议结果不满意，或者认为行政机关的行为侵犯了自己的合法权益，可以向人民法院提起行政诉讼。在行政诉讼中，法院将对行政行为的合法性进行审查，并作出判决。对于补偿协议，如果认为其存在违法或不当之处，可以在诉讼中提出相应的诉讼请求。
民事诉讼（针对协议本身）：
- 如果补偿协议本身存在争议，如协议内容不明确、存在欺诈或胁迫等情形，也可以考虑通过民事诉讼来解决。在这种情况下，需要向人民法院提起民事诉讼，请求法院对协议进行解释、修改或撤销。
三、建议与注意事项
- 保留证据：在协商、复议或诉讼过程中，务必保留好与补偿协议相关的所有证据，如协议文本、沟通记录、相关法律法规等。
- 及时行动：如果对补偿协议不满意，应及时采取行动，避免超过法定的复议或诉讼期限。
- 寻求专业帮助：由于法律程序复杂且专业性强，建议寻求专业律师的帮助，以确保自己的权益得到充分维护。
总结来说，虽然不能直接对补偿协议申请复查，但可以通过协商、行政复议、行政诉讼或民事诉讼等合法途径来维护自己的权益。如果你在此过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。