在建筑公司将工程承包给内部员工，因工程款结算产生矛盾时，起诉案由的确定需结合具体法律关系和事实情况，常见案由有以下两种：

1. 建设工程合同纠纷
   若内部员工以个人名义或挂靠其他单位名义与建筑公司签订了书面或事实上的工程承包合同，且合同内容符合《民法典》中关于建设工程合同的规定（如涉及工程范围、建设工期、工程质量、工程造价等条款），则双方争议属于建设工程合同纠纷。此时，建筑公司或员工可依据合同约定，以“建设工程合同纠纷”为案由起诉，要求支付工程款、赔偿损失或承担违约责任。
   关键点：需证明双方存在工程承包合同关系，且争议焦点为工程款结算（如工程量计算、计价方式、付款条件等）。

2. 劳务合同纠纷或追索劳动报酬纠纷
   若内部员工与建筑公司之间未签订工程承包合同，而是以提供劳务的形式参与工程（如仅负责施工管理、技术指导或具体劳务作业），且双方约定按工作量或时间支付报酬，则争议可能属于劳务合同纠纷或追索劳动报酬纠纷。此时，员工可主张建筑公司拖欠劳务费或工资，建筑公司则可能以员工未完成工作或存在质量问题抗辩。
   关键点：需证明双方存在劳务关系（如考勤记录、工资支付凭证、工作安排等），且争议焦点为劳务报酬的支付。

补充说明：

• 若内部员工同时具备“内部职工”和“实际施工人”双重身份（如员工以公司名义承包工程，但实际自行组织施工、自负盈亏），可能涉及“实际施工人权利保护”问题，此时案由仍为建设工程合同纠纷，但员工可依据《建设工程司法解释》突破合同相对性，直接向发包方主张权利。
  
• 案由的确定需结合具体证据（如合同、结算单、付款凭证、沟通记录等），建议根据争议焦点和证据情况综合判断。
  

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