结论：工伤认定后，停工留薪期工资的确定与支付，并不完全依赖于是否单独进行了停工留薪期的鉴定，但停工留薪期确实可以通过特定程序进行单独鉴定或确认，且该鉴定或确认结果将作为支付停工留薪期工资的依据。以下是对此问题的详细分析：
一、停工留薪期的确定与鉴定
确定方式：
- 停工留薪期的确定主要基于工伤职工的伤情、病情及医疗机构的诊断证明或建议书。通常，根据医疗机构出具的诊断证明、休假证明等来确定停工留薪期，一般以住院时间加上出院后医嘱建议休息的时间来综合判断。
- 在部分地区，如河北省，通过制定专门的管理办法（如《河北省工伤职工停工留薪期管理暂行办法》），明确规定了工伤职工或用人单位对停工留薪期有异议时，可向劳动能力鉴定委员会提出确认申请，由专家进行鉴定。
鉴定程序：
- 若工伤职工或用人单位对医疗机构提出的停工留薪期意见有异议，可向设区的市级劳动能力鉴定委员会提出确认申请。
- 提交相关材料，包括工伤认定决定书、医疗机构诊断证明、病历等，以支持其主张。
- 劳动能力鉴定委员会收到申请后，审核材料并组织专家进行综合评估，考虑工伤职工的伤情、治疗情况、康复进度等因素，确定停工留薪期的具体时长。
- 鉴定/确认结束后，劳动能力鉴定委员会在规定时间内作出结论，并书面通知申请方，该结论具有法律效力，作为停工留薪期执行的依据。
二、停工留薪期工资的支付
法律依据：
- 根据《工伤保险条例》第三十三条的规定，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。
支付条件：
- 工伤职工在停工留薪期内，只要符合停工留薪期的确定条件，即有权要求单位按照原工资福利待遇支付停工留薪期工资。
- 原工资福利待遇一般应按照职工因工作遭受事故伤害或者患职业病前12个月的平均工资来计算。如果工作不满12个月的，则按照实际工作的月数计算平均工资。
时长限制：
- 停工留薪期一般不超过12个月。伤情严重或者情况特殊时，经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认，可以适当延长，但延长的期限也不得超过12个月。
三、关于单独鉴定与赔偿的申请
单独鉴定：
- 如前所述，停工留薪期可以通过特定程序进行单独鉴定或确认。若工伤职工或用人单位对停工留薪期有异议，可依法向劳动能力鉴定委员会提出申请。
赔偿申请：
- 在停工留薪期确定后，工伤职工有权要求单位按照原工资福利待遇支付停工留薪期工资。若单位拒绝支付，工伤职工可通过法律途径维护自己的合法权益，包括但不限于向劳动监察部门投诉、提起劳动仲裁或诉讼等。
四、注意事项与建议
- 在整个过程中，工伤职工应保留好所有相关证据和材料，如工伤认定决定书、医疗机构诊断证明、病历、工资单等，以便在需要时进行申诉或复议。
- 若对劳动能力鉴定委员会的结论有异议，可依法申请再次鉴定或提起行政诉讼。
- 工伤职工在发生工伤后，应及时向单位提出停工留薪的申请，并提供相关的医疗证明或休假证明。
总结：工伤认定后，停工留薪期工资的支付并不完全依赖于是否单独进行了停工留薪期的鉴定，但停工留薪期确实可以通过特定程序进行单独鉴定或确认。工伤职工在停工留薪期内有权要求单位按照原工资福利待遇支付工资，若单位拒绝支付，可通过法律途径维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。