结论：公司实行大小周制度遇到国家规定的周六上班，一般算作一天的工作时间，但具体是否算作加班以及加班工资的计算，需结合公司的工作制度、劳动合同以及相关法律法规来综合判断。
分析说明：
大小周制度的理解：
- 大小周制度是一种工作制度，即一周工作6天（大周），下一周工作5天（小周），如此循环。这种制度下，员工在某些周六是需要上班的。
国家规定的周六上班情况：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动者每日工作时间不超过8小时，平均每周工作时间不超过44小时。若公司实行标准工时制，且周六为正常工作日（非休息日调整），则周六上班应计入正常工作时间。
- 若公司实行的是综合计算工时工作制或不定时工作制，且经过劳动行政部门批准，那么周六上班可能被视为正常工作时间的延伸，但同样需确保劳动者平均每日和每周的工作时间不超过法定标准。
- 特殊情况：如果国家规定的节假日（如春节、国庆等长假）中的周六被调整为工作日，那么这一天的工作性质可能因节假日的特殊性而有所不同，但通常仍算作一天的工作时间，只是可能涉及节假日加班工资的计算。
加班工资的计算：
- 如果周六上班被认定为加班（即超出了正常的工作时间或工作周数），那么根据《中华人民共和国劳动法》的规定，劳动者有权获得加班工资。
- 加班工资的计算通常基于劳动者的基本工资和加班时长。具体计算公式可能因地区和公司政策而异，但一般原则是：工作日加班工资不低于工资的百分之一百五十；休息日加班工资不低于工资的百分之二百；法定节假日加班工资不低于工资的百分之三百。
- 在大小周制度下：若周六上班属于大周中的正常工作日，且未超出每周44小时的工作时间限制，则通常不算作加班，无需支付加班工资。但若因公司安排导致劳动者在大周中的周六工作时间过长，或在小周中也被要求上班，则可能构成加班，需支付相应加班工资。
行动建议：
劳动者：
- 首先查看自己的劳动合同和公司的工作制度，了解周六上班的具体性质和加班工资的计算方式。
- 如果认为自己的权益受到侵害（如未获得应有的加班工资），可以与公司进行协商，或向当地的劳动监察部门投诉。
公司：
- 应明确告知劳动者大小周制度的具体安排和加班工资的计算方式，确保劳动者的知情权。
- 遵守相关法律法规，确保劳动者的工作时间不超过法定标准，并按时支付加班工资。
法律后果：
- 如果公司未按照法律法规支付加班工资，劳动者有权要求公司补发，并可能因此获得一定的经济补偿。
- 在严重情况下，公司可能面临劳动监察部门的处罚和劳动者的法律诉讼。
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