公司擅自修改考勤记录属于违法行为，员工有权通过法律途径维护自身权益。以下是具体分析和应对建议：

1. 公司修改考勤记录的违法性
   根据《劳动合同法》第三条，劳动者与用人单位建立劳动关系时，双方地位平等，公司无权单方面修改已确认的考勤记录。若公司未经员工同意擅自修改，可能涉及以下违法行为：

   • 克扣工资：考勤记录直接影响工资计算，修改记录可能导致员工工资被非法减少，违反《工资支付暂行规定》第十五条；
     
   • 侵犯知情权：员工有权知晓自己的考勤情况，公司修改记录剥夺了员工的知情权；
     
   • 违反诚信原则：修改记录可能构成欺诈，影响员工对公司的信任，甚至涉及劳动合同的变更问题。

2. 员工如何应对公司修改考勤记录

   • 收集证据：
     员工应第一时间保存原始考勤记录（如打卡截图、考勤表照片、系统记录等），并收集与公司沟通的证据（如邮件、聊天记录、录音等），证明公司存在修改行为。
     
   • 与公司协商：
     员工可先与公司人力资源部门或上级沟通，要求公司解释修改原因，并出示修改前的原始记录。若公司拒绝提供或态度强硬，员工可明确表示反对修改行为。
     
   • 向劳动监察部门投诉：
     若协商无果，员工可向当地劳动监察大队投诉，要求对公司进行调查。劳动监察部门有权责令公司改正违法行为，并可能对公司进行处罚。
     
   • 申请劳动仲裁：
     若公司行为导致员工工资损失或其他权益受损，员工可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司赔偿损失、恢复原始考勤记录或确认劳动关系。
     

3. 特殊情况处理

   • 公司以“系统错误”为由修改记录：
     若公司声称修改是因系统故障，员工可要求公司提供系统维护记录或第三方技术鉴定，证明修改的合理性。若公司无法提供，则修改行为仍属违法。
     
   • 公司以“员工违规”为由修改记录：
     若公司主张修改是因员工存在迟到、早退等违规行为，员工可要求公司提供违规证据（如监控录像、证人证言等）。若公司无法证明，则修改行为无效。
     

温馨提示：考勤记录是劳动关系中的重要证据，员工应定期备份自己的考勤数据，并在发现异常时及时采取行动。若您遇到公司修改考勤记录的情况，可直接向我咨询具体应对方案，我会根据您的实际情况提供详细指导。