关于“员工迟到被安排休息是否合法”的问题，需根据具体情况综合判断，以下为详细分析：
不合法情形
- 规章制度未履行民主程序：根据《劳动合同法》第四条，用人单位制定涉及劳动者切身利益的规章制度（如考勤、奖惩等），应当经职工代表大会或全体职工讨论，并与工会或职工代表平等协商确定。若迟到被安排休息的规定未经此程序制定，则不合法。
- 规章制度未公示告知：用人单位需将规章制度公示或告知劳动者。若未公示或告知，劳动者可能不知晓该规定，因此不能作为处理依据。例如，公司未在入职培训中说明迟到处理方式，也未在内部公告栏张贴相关制度，直接以迟到为由安排休息，即属违法。
- 扣休息时间显失公平：若迟到几分钟即被扣除较长时间的休息（如迟到5分钟扣1小时休息），明显加重劳动者责任，违反公平原则，应认定为不合法。
- 侵犯劳动者休息权：根据《宪法》和《劳动法》，劳动者享有休息休假的权利。若因迟到过度扣减休息时间，导致劳动者无法保证基本休息（如连续工作超过法定时长），即侵犯休息权，属违法。
- 工资低于最低工资标准：无论何种扣罚，劳动者工资不得低于当地最低工资标准。若因迟到安排休息导致工资降低至此标准以下，同样构成违法。
合法情形
- 合法依规制定并告知：若规章制度经民主程序制定，已向劳动者公示或告知，且迟到安排休息的内容合理（如迟到30分钟扣30分钟休息），未违反法律法规和公平原则，则合法。
- 劳动者事先同意：若劳动者在入职时或工作过程中，自愿与用人单位达成协议，同意迟到时用休息时间抵偿，且协议不存在欺诈、胁迫等情形（如书面协议明确约定），则迟到安排休息可能合法。但需注意，此类协议需劳动者明确同意，且不得违反最低工资标准等强制性规定。
实际应用建议
- 对用人单位：确保规章制度合法合理，遵循民主程序制定，及时公示告知劳动者；扣罚休息时间需与迟到时长相当，避免过度扣罚；定期审查规章制度，确保符合最新法律法规要求。
- 对劳动者：了解自身权益，关注用人单位规章制度；若认为扣罚不合理或侵犯权益，可先与用人单位协商；协商无果，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
总结：员工迟到被安排休息是否合法，需结合规章制度制定程序、公示告知情况、扣罚合理性及是否侵犯权益等因素综合判断。若用人单位规章制度合法且合理，且劳动者事先知晓并同意，则可能合法；反之，则可能违法。如有具体疑问或需进一步帮助，可直接向我咨询。