结论：清明节按国家规定休假，公司不应扣工资。

分析说明：

1. 法定节假日的休假性质：

   • 清明节是我国的法定节假日，根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，劳动者在法定节假日享有休假的权利，且休假期间应视为正常出勤，享受与正常工作期间相同的工资待遇。

2. 工资支付规定：

   • 根据《劳动法》第四十四条的规定，有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：…（三）法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。但此条款针对的是法定休假日安排工作的情况，对于法定休假日休假，则应理解为正常支付工资，不额外扣减。
   • 实际上，在法定节假日休假，劳动者并未提供劳动，但法律已通过规定法定休假日的工资支付标准（即视为正常出勤）来保障劳动者的权益，因此公司不应扣减工资。

3. 公司扣工资的违法性：

   • 如果公司在法定节假日休假期间扣减劳动者工资，这违反了《劳动法》的相关规定，劳动者有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，要求公司补发工资并可能获得相应的赔偿。

行动建议：

• 如果您遇到公司在清明节等法定节假日休假期间扣减工资的情况，首先应与公司进行沟通，明确表达您的权益和诉求。
• 如果公司拒绝补发工资或存在其他违法行为，您可以向当地的劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

法律后果：

• 公司如果违反《劳动法》的规定，在法定节假日休假期间扣减劳动者工资，将可能面临劳动监察部门的处罚，包括但不限于罚款、责令改正等。
• 同时，公司还可能因违法行为而承担民事赔偿责任，即需要向劳动者补发工资并可能支付额外的赔偿金。