事业单位在编人员被停工资是否违法，需根据具体情况来判断。以下是对此问题的详细分析，希望能帮助您更清晰地理解相关法律规定及其实际应用。
合法停发工资的情形
劳动者未提供劳动：
- 若您无正当理由未出勤工作，单位停发工资是合法的。例如，您旷工多日，严重违反考勤制度，单位在旷工期间停发工资。
与单位达成协议：
- 若您与事业单位就停发工资事宜达成一致，且协议不违反法律法规，则单位停发工资不违法。如您申请停薪留职，双方签订协议约定停发工资。
受到纪律处分：
- 依据《事业单位工作人员处分暂行规定》，受降低岗位等级或撤职处分的员工，单位可从处分决定的次月起降低其工资待遇；受开除处分的，则终止人事关系并停发工资。
涉嫌违法犯罪：
- 若您涉嫌违法违纪被立案调查期间，单位可根据干部人事管理权限暂停您的工资待遇，待调查结束后再依法处理。
离职或请假：
- 若您因离职、请假等原因无法提供正常劳动，且单位有明确的规章制度并提前告知您，则停发工资是合法的。
违法停发工资的情形
无正当理由：
- 单位无任何合理依据随意停发您的工资，违反了《中华人民共和国劳动法》第五十条，即工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
违反法定程序：
- 即使存在可以停发工资的事由，但单位未按法定程序操作也构成违法。如未将规章制度告知您，或未进行调查核实、未给予您申辩机会就停发工资。
打击报复您依法维权：
- 若您依法行使合法权益（如参加工会活动、举报违法行为）时，单位停发工资进行打击报复，违反了《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律。
实际操作建议
- 对于事业单位：应建立健全的规章制度，明确停发工资的具体情形和程序，并确保员工知晓。在停发工资前，应进行充分的调查核实，并给予员工申辩的机会。
- 对于您个人：若认为单位停发工资违法，可向劳动监察部门投诉，或申请劳动仲裁、提起诉讼以维护自己的合法权益。在采取这些行动前，建议您先收集相关证据，如工资条、考勤记录、与单位的沟通记录等，以便在维权过程中提供有力支持。
总结来说，事业单位停发工资的合法性需根据具体情况判断，包括停发的原因、程序以及规章制度等因素。若您对此仍有疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。