关于员工确认多年劳动关系至今在职上班是否存在“失效一年”的问题，结论前置如下：
劳动关系确认本身不存在“失效一年”的说法。劳动关系的确认是一个法律事实认定过程，一旦确认，除非有法定事由（如员工离职、被辞退、劳动合同终止等），否则劳动关系将持续存在。因此，员工确认多年劳动关系且至今在职上班，其劳动关系并未因时间推移而“失效”。
关于劳动争议申请仲裁的时效问题。虽然劳动关系确认本身不失效，但如果在劳动关系存续期间或终止后，员工与用人单位之间就劳动权益（如工资、加班费、经济补偿等）发生争议，并需要申请劳动仲裁来维护自己的权益时，需要注意劳动争议申请仲裁的时效期间。根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条的规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。但这里需要注意的是，这一时效规定是针对劳动争议申请仲裁的，而非针对劳动关系确认的。
进一步解释与说明：
劳动关系确认：劳动关系的确认通常是通过劳动合同、工资支付记录、工作证、考勤记录等证据来证明的。一旦确认，员工与用人单位之间就建立了法律上的劳动关系，这种关系受到法律的保护。
劳动争议申请仲裁的时效：在劳动关系存续期间或终止后，如果员工发现自己的劳动权益受到侵害（如未支付工资、未支付加班费、未依法缴纳社会保险等），可以在知道或应当知道权利被侵害之日起一年内申请劳动仲裁。这是为了促使员工及时维护自己的权益，避免证据灭失或难以收集的情况发生。但这一时效规定并不适用于劳动关系确认本身。
建议与提醒：
如果您作为员工，已经确认了多年的劳动关系且至今在职上班，但发现自己的某些劳动权益受到侵害，建议尽快收集相关证据，并在知道或应当知道权利被侵害之日起一年内申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
如果您作为用人单位，与员工之间就劳动关系或劳动权益存在争议，建议积极与员工沟通协商，寻求和解或调解的方式解决争议。如果无法达成一致，也应尊重员工的仲裁或诉讼权利，并积极配合相关部门的调查和处理工作。
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