用人单位可以主动申请仲裁或起诉确认与劳动者不存在劳动关系。这是用人单位在法律框架内的一种合法权利，旨在通过法律途径解决与劳动者之间关于劳动关系存在的争议。
一、法律依据
根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二条的规定，因确认劳动关系发生的争议属于劳动仲裁的受理范围。这意味着，不仅劳动者可以申请劳动仲裁来确认劳动关系的存在，用人单位同样有权提出此类申请。
二、申请条件与证据要求
用人单位在申请仲裁或起诉确认与劳动者不存在劳动关系时，需要满足一定的条件并提供相应的证据：
- 存在争议：明确与劳动者之间存在关于劳动关系是否存在的争议。
- 提供证据：提交能够证明劳动关系不存在或已终止的证据材料，如劳动合同终止通知书、员工离职证明、考勤记录、工资支付记录等。
三、劳动仲裁与诉讼流程
劳动仲裁：
- 提交申请：向劳动争议仲裁委员会提交书面仲裁申请，并附上相关证据材料。
- 受理审查：仲裁委员会对申请进行审查，决定是否受理。
- 开庭审理：组成仲裁庭，对案件进行公开或不公开的审理。
- 调解与裁决：在审理过程中，仲裁委员会会尝试进行调解；若调解不成，则根据事实和法律作出裁决。
诉讼：
- 若用人单位对仲裁结果不满意，可以在收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。
- 法院将依法对案件进行审理，并作出判决。
四、法律后果与建议
- 法律后果：若用人单位被裁决或判决与劳动者存在劳动关系，可能需要承担相应的法律责任，如支付工资、社会保险费用等。
- 建议：
- 用人单位在申请仲裁或起诉前，应充分评估自身证据材料的充分性和合法性。
- 若对法律程序或结果有疑问，建议及时咨询专业律师，以获取准确的法律意见和帮助。
综上所述，用人单位可以主动申请仲裁或起诉确认与劳动者不存在劳动关系，但在此过程中需要遵循相关法律法规和程序要求，并提供充分的证据来支持自己的主张。