结论前置：您和哥哥签订的土地确权转让协议若存在不合理之处，双方是可以自愿重新签订补充协议的，但需确保补充协议的内容合法、合规，并遵循一定的程序要求。
法律背景与解释：
合同自由原则：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同双方当事人在平等、自愿的基础上，有权自由约定合同的内容。这意味着，如果原土地确权转让协议存在不合理之处，双方完全有权通过协商，重新签订补充协议来修改或完善原协议的内容。
补充协议的合法性：
- 补充协议作为原合同的补充或修改，必须遵守国家法律法规的强制性规定，不得违反公序良俗。因此，在重新签订补充协议时，双方应确保协议内容合法、合规，不损害国家、集体或第三人的利益。
程序要求：
- 虽然补充协议的签订相对灵活，但为了确保其法律效力，双方最好采用书面形式，并明确约定补充协议与原协议的关系、修改或补充的具体内容等。此外，如果原协议已经进行了公证或登记等手续，补充协议也可能需要相应的手续来确保其法律效力。
法律建议：
协商沟通：
- 首先，建议您与哥哥进行充分的协商沟通，明确原协议中存在的不合理之处，并共同商讨如何修改或完善。在协商过程中，双方应保持平等、自愿的原则，尊重对方的权益和意见。
寻求专业意见：
- 在重新签订补充协议之前，建议您咨询专业的法律人士或律师，以确保补充协议的内容合法、合规，并符合双方的利益。律师可以为您提供专业的法律意见和建议，帮助您规避潜在的法律风险。
书面形式与公证：
- 为了确保补充协议的法律效力，建议您采用书面形式签订补充协议，并明确约定补充协议与原协议的关系、修改或补充的具体内容等。如果条件允许，您还可以考虑对补充协议进行公证或登记等手续，以进一步增强其法律效力。
可能的法律后果：
- 如果补充协议的内容合法、合规，并遵循了必要的程序要求，那么它将具有法律效力，对双方产生约束力。双方应按照补充协议的约定履行各自的义务，否则将承担相应的法律责任。
- 如果补充协议的内容存在违法或违规之处，或者未遵循必要的程序要求，那么它可能无法产生法律效力。在这种情况下，双方可能需要重新协商或寻求法律途径来解决争议。
进一步思考：
- 在重新签订补充协议之前，您还需要考虑原协议中是否存在其他潜在的问题或风险，以及补充协议是否能够完全解决这些问题或风险。
- 如果双方在协商过程中无法达成一致意见，或者补充协议签订后仍然存在争议，那么您可能需要考虑通过法律途径来解决争议，如诉讼或仲裁等。
总之，您和哥哥签订的土地确权转让协议若存在不合理之处，双方是可以自愿重新签订补充协议的。但为了确保补充协议的法律效力，建议您在签订前咨询专业的法律人士或律师，并遵循必要的程序要求。如果您有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。