核心结论：为避免后续纠纷，您与哥哥签订的协议需明确土地权属、流转方式、双方权利义务、违约责任等关键条款，并建议办理土地流转备案手续。以下是具体分析及协议要点：

一、协议签订前的法律要点

1. 权属确认
   需明确农田虽登记在您名下，但实际权属是否存在争议（如母亲是否保留权益、是否涉及家庭共有财产等）。若母亲健在且未明确放弃权益，建议先通过家庭会议或书面协议确认母亲的真实意愿，避免后续因权属不清引发纠纷。

2. 流转方式选择
   根据《农村土地承包法》第36条，土地经营权流转方式包括转包、出租、互换、转让等。若您哥哥仅需临时使用，可选择转包或出租（期限不超过承包期剩余年限）；若需永久转移权属，则需选择转让（需发包方同意并办理变更登记）。

二、协议核心条款（以转让为例）

1. 双方信息
   写明您与哥哥的全名、身份证号、联系方式，确保主体明确。

2. 土地信息
   详细描述农田位置、面积、四至范围、土地承包合同编号及登记情况（可附土地权证复印件）。

3. 流转内容

   • 明确流转方式为“转让”，并注明“自协议生效之日起，土地承包经营权归乙方（哥哥）所有”。
     
   • 若涉及补偿款，需写明金额、支付方式及时间（如“甲方一次性收取转让费XX元，于XX年XX月XX日前支付”）。

4. 双方权利义务

   • 甲方（您）义务：协助办理土地变更登记，提供权属证明文件。
     
   • 乙方（哥哥）义务：按约定用途使用土地（如农业种植），不得改变土地性质；承担后续税费及发包方要求的义务。

5. 违约责任

   • 若哥哥未按约定支付款项或擅自改变土地用途，需支付违约金（如转让费的20%）并赔偿损失。
     
   • 若您隐瞒权属瑕疵导致协议无效，需返还已收款项并赔偿哥哥损失。

6. 争议解决
   约定纠纷解决方式（如协商不成，向农田所在地法院起诉）。

三、协议签订后的手续

1. 备案登记
   根据《农村土地承包法》第37条，土地经营权流转需向发包方（村委会）备案，并申请办理土地承包经营权变更登记（至县级农业农村部门），确保权属变更合法有效。

2. 证据留存
   协议签订后，建议通过邮寄或当面交付方式留存送达证据，并保存转账记录、收据等付款凭证。

四、风险提示

• 若母亲健在且未明确放弃权益，哥哥使用土地可能涉及侵犯母亲权益，建议提前与母亲沟通并签署书面同意文件。
  
• 若土地涉及征收补偿，协议中需明确补偿款归属（如“自协议生效之日起，土地征收补偿款归乙方所有”），避免后续争议。

示例条款（转让场景）：
“甲方自愿将位于XX村XX组的XX亩农田（承包合同编号：XX）的承包经营权转让给乙方，转让费XX元于XX年XX月XX日前支付。乙方承诺按农业用途使用土地，不得撂荒或改变性质。若违约，需支付转让费20%的违约金。”

如有其他细节需补充（如母亲权益处理、补偿款分配等），可进一步向我说明，我会协助完善协议内容。