结论前置：针对您提交了病历但公司仍按事假处理的情况，您可以通过与公司协商、申请劳动仲裁或提起诉讼等途径来维护自己的合法权益。以下是对此问题的详细分析：
一、法律背景与依据
在劳动工伤领域，员工因工作受伤或患病需要治疗时，有权享受相应的医疗期，并在此期间获得工资报酬。公司若将员工因工伤或患病的治疗期按事假处理，可能违反了相关法律法规。具体来说，根据《工伤保险条例》及《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》等，员工在医疗期内，公司应支付病假工资或疾病救济费，且不得随意解除劳动合同。
二、可能的情况与应对策略
公司未认识到问题的严重性
- 情况分析：公司可能对相关法律法规了解不足，误将您的医疗期当作事假处理。
- 应对策略：您可以首先尝试与公司进行友好协商，向公司人力资源部门或相关负责人解释相关法律法规，并提供病历等证明材料，要求公司按照法律规定支付病假工资。
公司故意违反法律法规
- 情况分析：若公司明知相关法律法规，但仍故意将您的医疗期按事假处理，这可能构成违法行为。
- 应对策略：
- 收集证据：保留好病历、诊断证明、与公司沟通的记录等证据，以备后续维权之需。
- 申请劳动仲裁：若协商无果，您可以向当地劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，要求公司支付病假工资、赔偿金等。
- 提起诉讼：若对劳动仲裁结果不满，您还可以向法院提起诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。
三、具体操作步骤与注意事项
与公司协商
- 步骤：准备病历、诊断证明等材料，与公司人力资源部门或相关负责人进行面对面沟通，明确表达您的诉求和法律依据。
- 注意事项：保持冷静和理性，避免情绪化交流；记录沟通过程和结果，以备后续参考。
申请劳动仲裁
- 步骤：撰写劳动仲裁申请书，明确仲裁请求和事实理由；提交病历、诊断证明、与公司沟通的记录等证据材料；按照当地劳动仲裁委员会的要求缴纳仲裁费用并等待开庭。
- 注意事项：确保仲裁请求明确、具体；证据材料充分、真实；遵守仲裁程序和时间要求。
提起诉讼
- 步骤：若对劳动仲裁结果不满，可以在收到仲裁裁决书之日起十五日内向法院提起诉讼；准备起诉状、证据材料等；按照法院的要求缴纳诉讼费用并等待开庭。
- 注意事项：确保起诉状内容准确、完整；证据材料充分、有力；遵守诉讼程序和时间要求。
四、后续行动建议
- 持续关注公司态度：在协商、仲裁或诉讼过程中，持续关注公司的态度变化，以便及时调整应对策略。
- 寻求专业帮助：若您对法律程序不熟悉或感到困惑，可以寻求专业律师的帮助，以确保您的权益得到充分维护。
最后，面对公司的不当处理，您有权通过法律途径维护自己的合法权益。如果您在此过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。