结论：工厂急辞工时，工资扣除情况主要取决于是否给用人单位造成了经济损失、劳动合同及公司规章制度的具体约定，既可能是扣除当月工资，也可能是扣除次月工资，甚至可能不扣工资，但通常不会直接扣除两个月的工资。以下是对此问题的详细分析：
一、法律规定与合同约定
法律规定：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条，劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。若劳动者未履行提前通知义务，可能构成违法解除劳动合同。
- 《工资支付暂行规定》第十六条规定，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
合同约定：
- 劳动合同中可能明确规定了员工急辞工的违约责任和扣款方式。若合同中有相关约定，且该约定不违反法律法规的强制性规定，则用人单位有权按照合同约定执行。
二、公司规章制度
- 用人单位的规章制度中也可能对急辞工的扣款问题作出规定。这些规章制度需经过民主程序制定并向员工公示，才能作为处理劳动争议的依据。
三、实际扣款情况分析
若未造成经济损失：
- 若员工急辞工但未给用人单位造成任何经济损失，或虽造成损失但无法证明，或用人单位无故扣发工资，则用人单位扣发当月或次月工资的行为缺乏法律依据，属于违法行为。此时，员工有权要求用人单位足额支付工资。
若造成经济损失：
- 若员工急辞工且给用人单位造成了经济损失，用人单位有权按照劳动合同的约定或相关法律法规，从劳动者的工资中扣除部分作为经济损失的赔偿。但扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
- 扣除当月还是次月工资：这主要取决于用人单位的财务制度和工资发放周期。如果经济损失在当月已经确定，且工资尚未发放，用人单位可能会选择扣除当月工资；如果经济损失在次月才确定，或者当月工资已经发放完毕，用人单位则可能会选择扣除次月工资。但无论如何，扣除的总额不得超过法定限制，且应确保劳动者的基本生活需求。
关于扣除两个月工资：
- 通常情况下，不会直接扣除两个月的工资。用人单位会根据实际情况和合同约定来确定扣款金额，且扣款需遵循法律法规的强制性规定，如每月扣除部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
四、建议与注意事项
查看劳动合同和公司规章制度：
- 员工在急辞工前，应仔细查看劳动合同和公司规章制度中关于急辞工扣款的规定，了解自己的权利和义务。
与用人单位协商：
- 若对扣款问题存在异议，可与用人单位进行协商沟通，寻求双方都能接受的解决方案。
保留证据：
- 若认为用人单位的扣款行为违法或不合理，应保留好相关证据（如劳动合同、工资条、扣款通知等），以便通过法律途径维护自己的合法权益。
咨询专业人士：
- 在处理此类问题时，由于涉及法律法规和合同约定等多个方面，建议咨询劳动法律专业人士以确保合法权益得到保障。当然，如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，也可以直接向我咨询。
综上所述，工厂急辞工时工资扣除情况复杂多变，需根据具体情况判断。在处理此类问题时，应综合考虑各方因素，确保合法权益得到保障。