针对您提出的“合同签了一年但工作了三年，这种情况下如何赔偿”的问题，这实际上涉及到劳动合同的续签、解除以及赔偿等多个方面。下面我将根据相关法律法规，为您详细解答。
首先，我们需要明确的是，虽然最初签订的劳动合同期限为一年，但双方在实际履行过程中，如果继续按照原合同条件或者新的条件进行工作，且没有提出异议，那么可以视为劳动合同的续签或者继续履行。在您的情况下，已经工作了三年，说明劳动合同已经得到了续签或者继续履行。
接下来，我们根据不同的解除劳动合同的情形来讨论赔偿问题：
一、劳动者主动辞职
一般情况：
- 如果您因个人原因主动提出辞职，且用人单位不存在违法行为（如未按照劳动合同约定提供劳动保护或劳动条件、未及时足额支付劳动报酬等），那么通常不需要支付经济补偿金。
特殊情况：
- 若用人单位存在上述违法行为，您可以依据《劳动合同法》第三十八条解除劳动合同，并要求用人单位支付经济补偿金。经济补偿金的计算标准为每满一年支付一个月工资。由于您已经工作了三年，因此有权获得三个月工资的经济补偿金（但需注意，这里的“一年”是指您在用人单位的实际工作年限，而非最初签订的劳动合同期限）。
二、用人单位违法解除劳动合同
- 如果用人单位无故辞退您，属于违法解除劳动合同的行为。根据《劳动合同法》第八十七条的规定，用人单位应当依照经济补偿标准的二倍向您支付赔偿金。由于您已经工作了三年，经济补偿金为三个月工资，因此赔偿金应为六个月工资。
三、用人单位合法解除劳动合同（非过失性辞退）
协商一致解除：
- 如果用人单位与您双方协商一致解除劳动合同，用人单位需按您在本单位工作的年限支付经济补偿。具体为每满一年支付一个月工资的标准。对于您工作三年的情况，经济补偿即为三个月工资。
无过错性辞退：
- 依据《劳动合同法》第四十条，如您患病或非因工负伤无法继续工作，或不能胜任工作经培训或调整岗位后仍不能胜任等情形，用人单位在提前三十日书面通知或额外支付一个月工资后，可解除劳动合同，并按工作年限支付经济补偿。同样，对于您工作三年的情况，经济补偿为三个月工资。
四、建议与总结
了解自身权益：
- 在处理劳动合同解除及赔偿事宜时，您应首先了解自身的权益和法律法规的相关规定。
与用人单位沟通：
- 如果可能的话，尝试与用人单位进行沟通协商，看是否能够达成一致的解决方案。
寻求法律援助：
- 如果您的权益受到侵害，且无法通过沟通协商解决，可以寻求专业律师的帮助或者向当地劳动仲裁机构申请劳动仲裁。
保留证据：
- 在整个过程中，务必保留好相关证据（如劳动合同、工资单、工作证明等），以便在需要时证明自己的权益。
综上所述，赔偿的具体金额和方式取决于劳动合同的解除原因和双方的协商情况。希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时告诉我。