结论：公司规定不合理，一般不直接构成申请劳动仲裁的事由，但当公司规定的不合理性导致具体违法行为，如克扣工资、不缴社保、工伤赔偿不合理等，损害劳动者合法权益时，劳动者可以申请劳动仲裁。以下是对此问题的详细分析：
一、公司规定不合理与劳动仲裁的关系
不可直接申请仲裁的情形：
- 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》，劳动仲裁主要针对的是用人单位与劳动者之间因确认劳动关系、劳动合同的订立履行变更解除终止、工作时间休息休假、社会保险福利培训、劳动保护、劳动报酬工伤医疗费经济补偿或赔偿金等发生的争议。
- 公司规定本身的不合理性，如规定过于严苛、不合理的工作任务分配等，通常并不直接属于上述可申请劳动仲裁的事项范畴。
可申请仲裁的情形：
- 如果公司不合理的规定导致了具体的违法行为，如无故降低工资待遇、不缴纳社会保险费、工伤赔偿不合理等，这些行为直接损害了劳动者的合法权益，劳动者可以针对这些具体行为申请劳动仲裁。
二、申请劳动仲裁的具体条件与流程
准备充分证据：
- 要证明公司规定的不合理性以及该规定对自己权益造成的具体损害。证据包括但不限于劳动合同、工资条、考勤记录、与公司沟通相关问题的邮件或聊天记录、公司发布规定的文件、工伤认定决定书、劳动能力鉴定结论、医疗费用票据等。
- 例如，若因公司不合理的考勤制度被错误扣工资，考勤记录和工资条就是关键证据；若工伤赔偿不合理，则需提供工伤认定决定书、劳动能力鉴定结论以及医疗费用票据等。
明确仲裁请求：
- 在申请仲裁时，需清晰提出自己的仲裁请求，如要求公司按照原工资标准发放工资、补缴社会保险费、支付合理的工伤赔偿等。
提交仲裁申请：
- 劳动者需在知道或应当知道其权利被侵害之日起一年内，向有管辖权的劳动争议仲裁委员会提交书面仲裁申请，并附上所有相关证据和副本。
仲裁受理与审理：
- 仲裁委员会将在收到申请后五日内决定是否受理，并通知申请人。若不符合受理条件，将书面说明理由。
- 仲裁庭会在开庭前五日通知双方当事人开庭日期和地点。在审理过程中，双方将进行举证、质证和辩论，以查明事实真相。
仲裁调解与裁决：
- 仲裁庭会首先尝试调解，若调解成功，则制作仲裁调解书；若调解不成或调解书送达前一方反悔，仲裁庭将及时作出裁决。裁决应在受理仲裁申请之日起四十五日内结束，复杂案件可经批准延期，但延长期限不得超过十五日。
三、常见的不合理规定情形及应对策略
经济处罚不合理：
- 如公司随意克扣员工工资、奖金或罚款金额过高且无明确规章制度依据。员工应收集相关证据，如劳动合同、工资条、处罚通知等，以证明公司处罚的不合理性，并通过仲裁争取恢复原工资待遇或获得相应赔偿。
不缴纳社会保险费：
- 公司未按照法律规定为员工缴纳社会保险费。员工应准备好劳动合同、工资条等证据，通过仲裁要求公司补缴社会保险费。
工伤赔偿不合理：
- 公司未按照法律规定支付工伤赔偿或赔偿金额过低。员工应重点收集工伤认定决定书、劳动能力鉴定结论以及医疗费用票据等证据，通过仲裁争取获得合理的工伤赔偿。
四、申请仲裁的建议
- 内部协商优先：在决定申请劳动仲裁前，建议劳动者先仔细研究公司规定，并与公司的人力资源部门或管理层进行沟通协商，尝试通过内部途径解决纠纷。
- 时效性：务必在规定的仲裁时效内提出申请，避免因超过时效而丧失胜诉权。
- 后续诉讼：如果对仲裁结果不满意，除法律另有规定外，劳动者可以在收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼，进一步争取自己的合法权益。
综上所述，当公司规定不合理且导致具体违法行为损害劳动者合法权益时，劳动者可以依法申请劳动仲裁来维护自己的权益。在申请仲裁前，建议劳动者先尝试内部协商解决纠纷，并准备好充分的证据以支持自己的仲裁请求。若你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。