员工违反公司规定，一般情况下不能直接申请劳动仲裁，但若因此引发劳动争议，如被公司违法解除劳动合同、未支付应得报酬等，员工可以申请劳动仲裁来维护自己的权益。以下从不同角度为你详细分析：

员工违反公司规定本身不属于劳动仲裁受理范围

劳动仲裁主要受理的是因履行劳动合同过程中产生的争议，比如因确认劳动关系、订立、履行、变更、解除和终止劳动合同、因劳动报酬、工伤医疗费、经济补偿或者赔偿金等发生的争议。员工单纯违反公司规定，如果没有引发上述具体的劳动争议事项，比如只是违反了公司的考勤制度但未被公司处理，或者公司只是进行了内部警告等，这并不构成劳动仲裁的受理事由。因为此时并没有涉及到员工与公司之间基于劳动关系的具体权利义务的实质性争议。

因员工违反公司规定引发劳动争议时可申请仲裁

1. 公司违法解除劳动合同：如果公司以员工违反规定为由解除劳动合同，但公司的规章制度制定程序不合法（比如未经过职工代表大会或者全体职工讨论，未与工会或者职工代表平等协商确定）、内容不合法（比如规定员工迟到一次就解除劳动合同，这种规定过于严苛且不合理）或者公司解除劳动合同的程序不合法（比如未事先将理由通知工会），那么公司解除劳动合同的行为就属于违法解除。此时员工可以申请劳动仲裁，要求公司支付违法解除劳动合同的赔偿金。赔偿金的计算公式为：赔偿金 = 工作年限 × 月工资 × 2。其中，工作年限是指员工在公司的工作时间，满一年按一年计算，六个月以上不满一年的按一年计算，不满六个月的支付半个月工资的经济补偿；月工资是指员工在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
2. 公司未支付应得报酬：假如员工违反公司规定，公司以此为由扣减员工工资，但扣减的部分超出了合理范围或者没有合法依据（比如公司规章制度中未明确规定违反该规定可扣减的工资数额及方式），导致员工应得的劳动报酬被克扣，员工可以申请劳动仲裁，要求公司支付被克扣的工资及可能的加付赔偿金。加付赔偿金的前提是劳动行政部门责令公司限期支付，公司逾期不支付的，劳动行政部门会责令公司按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向员工加付赔偿金。
3. 公司未依法给予相关待遇：例如员工违反规定后，公司拒绝为其缴纳社会保险或者住房公积金，员工可以就公司未依法缴纳社会保险或住房公积金的问题申请劳动仲裁（不过对于住房公积金问题，部分地区可能要求先向住房公积金管理中心投诉处理，对处理结果不服的再申请仲裁或诉讼）。员工可以要求公司补缴社会保险或住房公积金，若因此给员工造成损失的，还可以要求公司赔偿损失。

申请劳动仲裁的流程

1. 提交申请书：员工需要向劳动合同履行地或者用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会提交书面仲裁申请书，并按照被申请人人数提交副本。仲裁申请书应当载明员工的姓名、性别、年龄、职业、工作单位和住所，用人单位的名称、住所和法定代表人或者主要负责人的姓名、职务，仲裁请求和所根据的事实、理由，证据和证据来源、证人姓名和住所等内容。
2. 仲裁受理：劳动争议仲裁委员会收到仲裁申请之日起五日内，认为符合受理条件的，应当受理，并通知员工；认为不符合受理条件的，应当书面通知员工不予受理，并说明理由。
3. 开庭审理：仲裁庭在开庭五日前，会将开庭日期、地点书面通知双方当事人。员工和公司都有义务按照通知的时间、地点出席庭审，进行陈述、举证、质证和辩论等。
4. 仲裁调解：仲裁庭在作出裁决前，会先行调解，促使双方当事人自愿达成协议。如果调解达成协议，仲裁庭会制作调解书，调解书经双方当事人签收后，发生法律效力。
5. 仲裁裁决：如果调解不成或者调解书送达前，一方当事人反悔的，仲裁庭会及时作出裁决。对仲裁裁决不服的，员工可以在收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼；期满不起诉的，裁决书发生法律效力。

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