公司因为员工不搞卫生而将其辞退，这一行为是否违法，需根据具体情况来判断。以下是从不同角度进行的分析：
劳动合同与规章制度的角度：
- 如果劳动合同中明确规定了员工需要承担一定的卫生清洁职责，或者公司的规章制度中明确规定了不履行卫生清洁职责将构成严重违反公司规章制度的行为，且该规章制度已经过民主程序制定并公示，那么公司因员工不搞卫生而将其辞退，在程序上可能是合法的。但即便如此，公司也需要确保辞退决定是基于充分的事实依据，并且已经给予了员工合理的改正机会。
- 如果劳动合同或规章制度中并未明确规定卫生清洁职责，或者规定不够明确，那么公司仅凭员工不搞卫生就将其辞退，可能缺乏法律依据，构成违法辞退。
辞退程序的合法性：
- 无论基于何种原因辞退员工，公司都需要遵循法定的辞退程序。这通常包括提前通知员工、与员工进行协商、支付经济补偿（如果适用）等步骤。如果公司未遵循这些程序，即使辞退理由看似合理，也可能构成违法辞退。
- 特别是，如果公司未给予员工申辩或改正的机会，就直接辞退员工，这种行为很可能被认定为违法。
辞退理由的合理性：
- 辞退员工需要基于合理的理由。不搞卫生虽然可能影响工作环境和团队氛围，但通常并不构成直接辞退的充分理由。除非该行为严重影响了公司的正常运营或造成了重大损失，且这种影响或损失是员工故意或重大过失造成的。
- 如果公司仅凭员工不搞卫生这一轻微行为就将其辞退，而没有考虑其他更合理的处理方式（如警告、罚款、调岗等），那么这种辞退行为可能缺乏合理性，构成违法辞退。
建议：
- 如果你认为公司的辞退行为违法，你可以先与公司进行协商，要求公司说明辞退的具体理由和依据，并尝试达成和解。
- 如果协商无果，你可以向当地的劳动仲裁机构申请劳动仲裁，要求公司支付违法辞退的赔偿金等。
- 在整个过程中，建议你保留好相关证据（如劳动合同、规章制度、辞退通知、工作记录等），以便在需要时证明自己的权益。
可能后果：
- 如果劳动仲裁机构认定公司的辞退行为违法，公司可能需要支付你违法辞退的赔偿金，并可能面临其他法律责任。
- 如果劳动仲裁机构认定公司的辞退行为合法，那么你可能需要接受这一结果，并考虑其他就业机会。
总之，公司因为员工不搞卫生而将其辞退是否违法，需根据具体情况来判断。如果你对此有疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。