公司安排加班不算出勤天数，这一做法是否合法，需分情况讨论：

1. 工作日延时加班：

   • 根据《劳动法》第四十四条的规定，用人单位安排劳动者延长工作时间的，应支付不低于工资的150%的工资报酬。这里并未提及加班是否应计入出勤天数，但从工资报酬的支付要求来看，加班是劳动者额外付出劳动的时间，理应得到相应的报酬，且这种报酬的支付是基于劳动者实际提供了加班劳动这一事实。
   • 从出勤管理的角度，虽然法律没有明确规定加班必须计入出勤天数，但出勤天数通常反映了劳动者的工作时间和劳动量。将加班时间计入出勤天数，有助于更准确地反映劳动者的工作投入，也是对劳动者劳动的一种认可。如果公司仅支付加班费而不将加班时间计入出勤天数，可能在一定程度上忽视了劳动者的工作付出，但并不直接违反法律规定。不过，这种做法可能影响劳动者的其他权益，如全勤奖、绩效考核等，具体需看公司规章制度的规定。

2. 休息日加班：

   • 同样根据《劳动法》第四十四条，休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，应支付不低于工资的200%的工资报酬。这里明确提到了“不能安排补休”的情况下需支付加班费，意味着如果公司能够安排补休，则可以不支付加班费。但无论是否安排补休，休息日加班都是劳动者额外付出的劳动时间。
   • 关于出勤天数，如果公司安排了补休，那么从实际工作的角度来看，劳动者在休息日并未工作，因此不计入出勤天数在情理之中。但如果公司未安排补休而支付了加班费，将加班时间计入出勤天数则更为合理，因为这反映了劳动者实际的工作投入。不过，法律并未明确规定必须如此操作，因此主要取决于公司的规章制度和实际操作。

3. 法定节假日加班：

   • 根据《劳动法》第四十四条，法定节假日安排劳动者工作的，应支付不低于工资的300%的工资报酬，且不得安排补休。法定节假日是劳动者依法享有的休息时间，公司安排加班需支付高额的加班费作为补偿。
   • 关于出勤天数，法定节假日加班是劳动者在法定休息时间内的额外工作，从劳动法的立法精神来看，这种加班应得到特别的认可和补偿。因此，将法定节假日加班时间计入出勤天数，不仅是对劳动者劳动的认可，也是符合劳动法立法精神的。如果公司未将法定节假日加班时间计入出勤天数，可能在一定程度上损害了劳动者的权益。

建议与总结：

• 对于公司：在制定出勤管理制度时，应充分考虑加班时间的计入问题。从公平、合理的角度出发，建议将加班时间（特别是法定节假日加班时间）计入出勤天数，以更准确地反映劳动者的工作投入和劳动量。同时，公司应确保加班费的支付符合法律规定，以维护劳动者的合法权益。
• 对于劳动者：如果公司未将加班时间计入出勤天数，且影响了自己的其他权益（如全勤奖、绩效考核等），可以与公司进行沟通协商。如果沟通无果，可以向当地劳动监察部门投诉或寻求法律援助。

总之，公司安排加班不算出勤天数是否合法，需根据具体情况和公司的规章制度来判断。但无论如何，公司都应确保加班费的支付符合法律规定，并尽量做到公平、合理地管理出勤和加班时间。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。