父亲去世后，母亲、儿子、女儿自己签订的房产分配协议，在符合法定条件的情况下，是具有法律效应的。以下从多个角度进行详细分析：
一、协议有效的法定条件
主体适格：签订协议的各方必须具备完全民事行为能力。在此情况下，母亲、儿子、女儿作为成年人，通常具备完全民事行为能力，可以签订房产分配协议。
意思表示真实：协议必须是各方真实意思的表示，不存在欺诈、胁迫等情形。如果协议是在平等、自愿的基础上签订的，且各方对协议内容有充分的理解，那么协议就是有效的。
内容合法：协议内容必须符合法律法规的规定，不得违反公序良俗。房产分配协议应当明确房产的归属、分配方式等，且不得损害国家、集体或第三人的利益。
形式合法：虽然房产分配协议不一定需要采用书面形式，但为了确保协议的明确性和可证明性，建议采用书面形式，并由各方签字或盖章确认。如果房产涉及不动产登记，还需要按照相关规定办理过户手续。
二、可能影响协议效力的因素
遗嘱的存在：如果父亲在去世前留下了遗嘱，且遗嘱中明确规定了房产的分配方式，那么遗嘱的效力将优先于房产分配协议。在这种情况下，房产应当按照遗嘱进行分配。
其他继承人的权益：除了母亲、儿子、女儿外，如果父亲还有其他继承人（如其他子女、父母等），且这些继承人未放弃继承权，那么房产分配协议可能涉及侵犯其他继承人权益的问题。在这种情况下，协议可能部分无效或全部无效。
协议履行中的问题：如果协议签订后，各方在履行过程中出现争议或违约行为，也可能影响协议的效力。例如，如果一方拒绝按照协议分配房产，另一方可以通过法律途径维护自己的权益。
三、法律建议
咨询专业律师：在签订房产分配协议前，建议咨询专业律师，确保协议内容合法、有效，并符合各方的利益。律师可以提供专业的法律意见，帮助各方明确权利义务，避免潜在的法律风险。
完善协议内容：协议应当明确房产的具体信息（如地址、面积、产权证号等）、分配方式、过户时间、违约责任等，以确保协议的明确性和可执行性。
办理过户手续：如果协议涉及房产过户，应当按照相关规定办理过户手续，确保房产的合法归属。过户手续完成后，房产的产权将发生转移，各方应当遵守协议约定，不得擅自变更或撤销。
保留相关证据：在签订和履行协议过程中，各方应当保留相关证据（如协议文本、签字或盖章的复印件、过户手续等），以备不时之需。如果发生争议或违约行为，这些证据将有助于维护各方的权益。
如果您在房产分配协议方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。