公司员工注册公司与公司交易，并不直接等同于职务侵占，是否构成职务侵占需根据具体情况来判断。以下从多个角度进行分析：
一、职务侵占的构成要件
职务侵占罪是指公司、企业或者其他单位的工作人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的行为。其构成要件主要包括：
- 主体要件：必须是公司、企业或者其他单位的工作人员。
- 主观要件：必须具有非法占有的目的。
- 客观要件：必须利用职务上的便利，实施了侵占本单位财物的行为。
- 客体要件：侵犯的是公司、企业或者其他单位的财产所有权。
二、员工注册公司与公司交易的情况分析
员工注册公司并正常交易：
- 如果员工注册的公司与公司之间的交易是合法、合规的，且没有利用职务上的便利进行不正当操作，如操纵交易价格、虚构交易等，那么这种行为通常不构成职务侵占。
- 例如，员工注册了一家销售公司，与公司正常签订销售合同，按照市场价格进行交易，且交易过程透明、合规，那么这种行为就是合法的。
员工注册公司并利用职务便利进行不正当交易：
- 如果员工利用职务上的便利，如掌握公司采购、销售等关键环节的信息或权力，通过注册的公司与公司进行不正当交易，如抬高采购价格、压低销售价格等，从而非法占有公司财物，那么这种行为可能构成职务侵占。
- 例如，员工作为采购部门负责人，注册了一家供应商公司，并通过操纵采购价格，使公司以高于市场价的价格从该供应商公司采购商品，从而非法占有公司差价部分，这种行为就可能构成职务侵占。
三、法律建议
对于公司而言：
- 应建立健全内部控制制度，加强对员工行为的监督和管理，防止员工利用职务便利进行不正当交易。
- 一旦发现员工存在职务侵占行为，应及时收集证据并报警处理，以维护公司的合法权益。
对于员工而言：
- 应遵守职业道德和法律法规，不得利用职务便利进行不正当交易或非法占有公司财物。
- 如果员工注册的公司与公司之间存在交易关系，应确保交易过程合法、合规、透明，避免引发不必要的法律纠纷。
四、可能的法律后果
如果员工的行为构成职务侵占罪，将可能面临以下法律后果：
- 刑事责任：根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，职务侵占罪可处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；数额巨大的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；数额特别巨大的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金。
- 民事责任：员工还需承担赔偿公司损失等民事责任。
综上所述，公司员工注册公司与公司交易并不直接等同于职务侵占，是否构成职务侵占需根据具体情况来判断。如果你或你的公司遇到类似问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。