结论：员工离职后，即便已通过微信确认好工资，若员工反悔，公司需根据具体情况采取相应措施。以下从不同角度为你详细分析：
一、微信确认工资的法律效力
微信作为电子数据的一种形式，在法律上是可以作为证据使用的。如果双方在微信中明确确认了工资数额、支付时间等关键信息，且该确认过程不存在欺诈、胁迫等情形，那么这份微信确认通常具有法律效力。然而，微信确认的效力也受到一定限制，比如，如果确认内容存在模糊不清或歧义，或者后续双方有新的约定或行为改变了原确认内容，那么微信确认的效力可能会受到影响。
二、员工反悔的可能情况及应对
员工对工资数额有异议：
- 如果员工反悔是因为对之前确认的工资数额有异议，公司应首先核实工资计算是否准确，包括考勤记录、绩效评估等。
- 如果工资计算无误，公司可以向员工解释工资构成和计算方式，提供相关证据支持自己的主张。
- 如果员工仍然坚持异议，且双方无法协商一致，公司可以考虑通过法律途径解决，如申请劳动仲裁。
员工要求额外补偿或福利：
- 如果员工反悔是因为要求额外的补偿或福利，公司应明确告知员工，双方之前已经通过微信确认了工资，且该确认具有法律效力。
- 如果员工的要求没有法律依据或合同依据，公司可以拒绝支付，并建议员工通过合法途径解决争议。
员工以其他理由反悔：
- 如果员工以其他理由反悔，如个人原因、家庭变故等，公司应了解具体情况，并评估是否需要给予一定的理解和支持。
- 然而，如果员工的反悔行为违反了双方之前的约定或公司的规章制度，公司有权按照相关规定处理，包括但不限于拒绝支付额外费用、要求员工承担违约责任等。
三、法律建议及风险防范
完善工资确认流程：
- 为了避免类似纠纷的发生，公司应完善工资确认流程，确保双方对工资数额、支付时间等关键信息有明确的约定。
- 可以考虑采用书面形式进行工资确认，并要求员工签字确认，以增加证据的效力。
保留相关证据：
- 公司应妥善保留与工资确认相关的所有证据，包括微信聊天记录、考勤记录、绩效评估表等。
- 这些证据在后续可能发生的劳动争议中将起到至关重要的作用。
及时沟通协商：
- 如果员工反悔，公司应首先尝试与员工进行沟通协商，了解员工的具体需求和诉求。
- 通过沟通协商，双方可能能够找到一个互谅互让的解决方案，避免不必要的法律纠纷。
寻求法律帮助：
- 如果双方无法协商一致，且公司认为自己的权益受到了侵害，可以及时寻求法律帮助。
- 作为专业律师，我可以为你提供法律咨询和代理服务，帮助你维护合法权益。
最后，员工离职后微信确认工资反悔的情况需要公司根据具体情况采取相应措施。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。