结论：一个申请人以不同事实理由提起两次申请行政复议后，第三次是否可以不予受理，需根据具体情况判断，若第三次申请符合受理条件，则应当受理；若不符合受理条件，如属于重复申请等，则可以不予受理。
分析说明：
受理条件：
- 根据《中华人民共和国行政复议法》及相关规定，行政复议申请应当符合一定的条件，包括有明确的申请人和被申请人、有具体的行政复议请求和理由、在法定申请期限内提出等。
- 若申请人第三次提出的行政复议申请满足上述受理条件，且与前两次申请的事实理由不同，即不属于重复申请，那么行政复议机关应当受理。
重复申请的处理：
- 如果申请人第三次提出的行政复议申请与前两次申请的事实理由相同或相似，且已经就同一事项提出过行政复议申请并已被受理或处理过，那么这可能构成重复申请。
- 对于重复申请，行政复议机关可以根据相关规定不予受理，或者告知申请人已经就同一事项提出过申请并已被处理，避免浪费行政资源和司法资源。
特殊情况考虑：
- 即使第三次申请的事实理由与前两次不同，但如果存在其他不予受理的情形，如申请人不具备申请资格、申请超过法定期限等，行政复议机关也可以不予受理。
- 另外，如果行政复议机关认为第三次申请涉及的事项已经通过其他途径得到解决，或者申请的事项不属于行政复议范围，也可能不予受理。
法律建议：
- 对于申请人：在提出行政复议申请前，应仔细审查自己的申请是否符合受理条件，避免提出重复申请或不符合条件的申请。如果对行政复议程序或受理条件有疑问，可以咨询专业律师或相关机构。
- 对于行政复议机关：在收到行政复议申请后，应认真审查申请是否符合受理条件。对于符合条件的申请，应及时受理并依法处理；对于不符合条件的申请，应明确告知申请人不予受理的理由，并引导其通过其他途径解决争议。
后续行动：
- 如果申请人对行政复议机关不予受理的决定不服，可以根据相关规定提起行政诉讼或采取其他法律救济措施。
- 如果行政复议机关认为需要进一步了解情况或调查取证，可以要求申请人补充相关材料或提供证据，以确保行政复议的公正性和准确性。
如有更多疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。