公司扣钱不合理，劳动者可以申请劳动仲裁。
在劳动关系中，如果公司存在无正当理由扣减劳动者工资的行为，这通常被视为违法行为，因为劳动者的劳动报酬权是受法律保护的。以下是关于此问题的详细分析：
公司合法扣钱与不合理扣钱的区分：
- 合法扣钱：例如，员工违反公司依法制定且公示过的规章制度，如迟到早退达到一定次数、违反工作纪律等，公司按照规定扣钱属于合法行为。另外，如果员工给公司造成损失，公司也可以按照规定从员工工资中扣除一定金额用以弥补损失，但扣除部分不得超过当月工资的20%且扣除后工资不得低于当地最低工资标准。
- 不合理扣钱：如果公司无正当理由扣钱，如克扣工资来降低运营成本、无故扣除员工绩效奖金等，这种行为则属于不合理扣钱。
申请劳动仲裁的法律依据：
- 根据相关法律法规，劳动者因劳动报酬等发生的争议属于劳动仲裁的受案范围。因此，如果公司存在不合理扣钱的情况，劳动者有权向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。
申请劳动仲裁前的准备：
- 劳动者在申请劳动仲裁前，应收集相关证据以证明公司扣钱的不合理性。这些证据可能包括工资条、工资发放记录、公司通知扣钱的文件、劳动合同、考勤记录以及与公司沟通扣款问题的聊天记录等。
- 劳动者还需要在申请书中清晰地阐明公司扣款的不合理之处以及自身权益因该扣款行为而受到的损害情况。
劳动仲裁的流程：
- 劳动者向劳动合同履行地或者用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会递交申请。
- 仲裁委受理后会按程序安排开庭审理等事宜，并依法作出裁决。
- 如果仲裁裁决认定公司的扣款行为违法，劳动仲裁机构会责令公司将不合理扣除的款项返还给劳动者，并可能根据具体情况对公司作出相应的处罚。
综上所述，如果公司扣钱不合理，劳动者完全有权申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在申请劳动仲裁前，劳动者应做好充分的准备工作，并了解劳动仲裁的流程和相关法律规定。