结论前置：在工伤后停工留薪期的工资支付问题上，应按照您受伤前十二个月的平均工资来计算，而非入职时签订的合同工资3000元。因此，您应获得的停工留薪期工资应基于您实际的6900元工资水平来计算。

详细解释与法律依据：

1. 停工留薪期工资的计算依据：

   • 根据《工伤保险条例》第三十三条的规定，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这里的“原工资福利待遇”通常指的是职工受伤前十二个月的平均工资，而非入职时签订的合同工资。

2. 平均工资的计算方法：

   • 平均工资的计算应基于您受伤前十二个月的所有工资性收入，包括基本工资、奖金、津贴、补贴等。如果您的工资在受伤前有波动，那么应取这十二个月的平均工资作为计算基数。
   • 计算公式：\(平均工资 = \frac{受伤前十二个月工资总额}{12}\)。在您的情况下，如果6900元是您受伤前的平均工资，那么停工留薪期的工资就应按照这个数额来支付。

3. 合同工资与实际工资的差异处理：

   • 入职时签订的合同工资3000元，只是您与用人单位在劳动合同中约定的一个基本工资标准。但在实际工作中，您的工资可能因各种原因（如加班、奖金、绩效等）而高于这个标准。
   • 在工伤赔偿中，应更注重实际工资水平，以确保您的合法权益得到充分保障。因此，停工留薪期的工资应按照您实际的平均工资6900元来计算，而非合同工资3000元。

4. 可能的法律后果与建议：

   • 如果用人单位未按照您实际的平均工资水平支付停工留薪期的工资，您有权向用人单位提出异议，并要求其补足差额。
   • 如果用人单位拒绝补足或协商无果，您可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

进一步思考：

• 在处理工伤赔偿问题时，除了停工留薪期的工资外，还可能涉及医疗费、护理费、一次性伤残补助金等多项赔偿。因此，建议您在处理工伤赔偿时，全面了解自己的权益和赔偿标准，以确保获得充分的赔偿。
• 如果您在工伤赔偿过程中遇到任何疑问或困难，可以随时向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律建议和帮助。