结论：农村自建房交了预付款但未签合同，是否可以退款需视具体情况而定，包括双方协商、预付款性质、是否存在违约行为以及相关法律规定等因素。以下是对此问题的详细分析：
一、双方协商
协商退款：在未签订合同的情况下，双方首先应尝试通过友好协商解决退款问题。如果双方能够就退款金额、退款时间等事项达成一致，那么可以签订一份简单的退款协议，并按照协议履行。
协商不成：如果双方无法就退款问题达成一致，那么可能需要考虑通过法律途径解决。
二、预付款性质
定金性质：如果预付款被明确为定金，且根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，定金具有担保性质。若给付定金的一方不履行债务或者履行债务不符合约定，致使不能实现合同目的的，无权请求返还定金；收受定金的一方不履行债务或者履行债务不符合约定，致使不能实现合同目的的，应当双倍返还定金。但在此情况下，由于未签订合同，定金条款的效力可能存在争议，需要具体分析。
预付款性质：如果预付款仅被视为一种预先支付的款项，而不具有定金性质，那么在没有合同约束的情况下，退款的可能性相对较大。但具体能否退款，还需考虑双方是否存在其他约定或交易习惯。
三、是否存在违约行为
卖方违约：如果卖方在收到预付款后，因自身原因无法继续履行建房义务（如土地问题、规划问题等），那么买方有权要求退款，并可能要求卖方承担违约责任。
买方违约：如果买方在支付预付款后，因自身原因要求退款（如改变主意、资金问题等），那么卖方可能有权拒绝退款，或者要求买方承担一定的违约责任。但具体能否拒绝退款或要求违约责任，还需考虑双方是否存在其他约定或交易习惯。
四、相关法律规定
《中华人民共和国民法典》合同编：虽然双方未签订正式的书面合同，但如果双方已经就建房事宜达成了一致意见，并支付了预付款，那么可以视为双方已经成立了口头合同。根据《中华人民共和国民法典》合同编的相关规定，当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。因此，如果一方存在违约行为，另一方有权要求退款或承担违约责任。
农村土地和宅基地相关规定：农村自建房涉及土地和宅基地的使用问题，需要遵守相关法律法规的规定。如果建房行为违反了相关法律法规的规定（如未经批准擅自建房、超面积建房等），那么可能导致合同无效或被撤销，从而影响退款问题。
五、建议
收集证据：在尝试退款前，买方应收集相关证据，如支付预付款的凭证、双方沟通记录等，以证明自己的权益。
咨询专业律师：由于农村自建房涉及土地、宅基地等复杂问题，且未签订合同的情况下退款问题可能较为复杂，因此建议买方咨询专业律师，以获取更具体的法律建议。
尝试调解或仲裁：如果双方无法就退款问题达成一致，且不想通过诉讼解决纠纷，那么可以考虑尝试调解或仲裁等非诉讼方式解决纠纷。
最后，农村自建房交了预付款但未签合同是否可以退款，需根据具体情况进行判断。如果你在此方面遇到法律问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。