针对您提出的“军转的在单位辞职怎么办”这一问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，需要明确的是，军转干部在单位辞职的具体处理方式，会与其是否选择自主择业以及辞职后的就业状态有关。以下分情况为您详细说明：
一、自主择业军转干部辞职
退役金停发：
- 根据相关规定，自主择业军队转业干部被党和国家机关、人民团体或财政拨款的事业单位录用或聘用为正式工作人员的，从被录用或聘用的下月起停发退役金。
- 若您从上述单位辞职，根据规定，不再恢复自主择业军队转业干部待遇，即退役金不会因辞职而重新发放。
档案处理：
- 辞职后，用人单位需将您的档案及时退还安置地军队转业干部安置工作部门，不得转交第三方，并履行相应的档案交接手续。
- 但需注意，若您从党和国家机关、人民团体或财政拨款的事业单位辞职，其档案不再退还安置地军队转业干部安置部门。
社会保险：
- 自主择业军队转业干部就业后，应按照国家有关规定参加当地社会保险，履行缴费义务。
- 辞职后，您的社会保险关系将根据您的就业状态进行转移或续接。
二、非自主择业军转干部辞职
对于非自主择业的军转干部，其辞职后的处理方式可能因单位性质、地方政策等因素而有所不同。但一般来说，您需要：
与单位协商：
- 首先，与单位人事部门或相关负责人进行沟通，了解辞职的具体流程、所需材料以及可能涉及的补偿等问题。
办理离职手续：
- 按照单位要求，填写离职申请表、交接工作、归还单位财物等，完成离职手续。
关注后续待遇：
- 辞职后，您可能不再享受原单位提供的某些福利或待遇，如住房补贴、医疗保险等。因此，需要提前了解并规划好后续的生活和保障问题。
三、通用建议
了解政策：
- 在辞职前，务必详细了解国家和地方关于军转干部安置、辞职、社会保险等方面的政策规定，以便做出明智的决策。
咨询专业人士：
- 若对政策理解有疑问或需要进一步的帮助，可以咨询当地退役军人事务部门、人力资源和社会保障部门或专业律师等。
规划未来：
- 辞职后，您需要重新规划自己的职业生涯和生活路径。可以考虑继续就业、创业或享受退休生活等。
综上所述，军转干部在单位辞职后的处理方式会因其是否选择自主择业以及辞职后的就业状态而有所不同。在做出辞职决定前，请务必详细了解相关政策规定，并咨询专业人士的意见。希望这些解答能对您有所帮助。