鉴定意见采纳与否确实由法院决定，这一原则主要基于我国民事诉讼法的相关规定。以下从不同角度为你详细分析：

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国民事诉讼法》第七十九条：“当事人可以就查明事实的专门性问题向人民法院申请鉴定。当事人申请鉴定的，由双方当事人协商确定具备资格的鉴定人；协商不成的，由人民法院指定。当事人未申请鉴定，人民法院对专门性问题认为需要鉴定的，应当委托具备资格的鉴定人进行鉴定。”这一条款明确了鉴定程序的启动方式，无论是当事人申请还是法院依职权决定，最终都需要通过鉴定人来完成鉴定工作。
   • 更重要的是，《中华人民共和国民事诉讼法》第八十五条：“审判人员对案件的全部证据，应当依照法定程序，全面、客观地审核，并根据法律规定，运用逻辑推理和日常生活经验法则，对证据有无证明力和证明力大小进行判断，并公开判断的理由和结果。”这一条款赋予了法院对包括鉴定意见在内的所有证据进行审查判断的权力，法院有权决定是否采纳鉴定意见。

2. 法院审查鉴定意见的内容：

   • 法院在审查鉴定意见时，会关注鉴定人的资质、鉴定程序的合法性、鉴定方法的科学性以及鉴定结论的合理性等多个方面。如果鉴定意见存在瑕疵或不符合法律规定，法院有权不予采纳。
   • 例如，如果鉴定人没有相应的资质，或者鉴定程序存在违法情形，如未按照规定的步骤进行鉴定、未使用科学的鉴定方法等，这些都会影响鉴定意见的证明力，法院在审查时可能会不予采纳。

3. 实践中的操作：

   • 在实际诉讼中，当事人提交鉴定意见作为证据时，需要确保鉴定意见的合法性和有效性。如果对方对鉴定意见提出异议，法院会组织双方进行质证，并可能要求鉴定人出庭接受询问。
   • 法院在综合考量双方当事人的质证意见、鉴定人的出庭陈述以及案件的其他证据后，会作出是否采纳鉴定意见的决定。

4. 法律后果：

   • 如果法院采纳了鉴定意见，该意见将作为认定案件事实的重要依据。
   • 如果法院未采纳鉴定意见，当事人可以寻求其他证据来支持自己的主张，或者申请重新鉴定（在符合法律规定的情况下）。

总结来说，鉴定意见的采纳与否确实由法院决定，这是基于我国民事诉讼法的明确规定。法院在审查鉴定意见时，会综合考虑多个方面，确保鉴定意见的合法性和有效性。如果你在合同纠纷中遇到了与鉴定意见相关的问题，或者对鉴定意见的采纳有疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。