核心结论：针对房屋拆迁协议为父子两人，后期回迁合同却变成父亲一个人的情况，您可以通过以下途径来维护自身权益并尝试解决证照问题：

1. 核查合同变更原因：

   • 首先，需要详细核查回迁合同变更的具体原因。这可能是由于拆迁过程中的某些政策调整、家庭内部协商一致后的变更，或者是存在未经您同意的擅自变更情况。
   • 如果是家庭内部协商一致后的变更，那么需要确认是否有书面的变更协议，并且该协议是否符合相关法律法规的规定，是否体现了您的真实意愿。

2. 收集证据材料：

   • 收集所有与拆迁和回迁相关的文件，包括拆迁协议、回迁合同、任何变更协议（如果有的话）、沟通记录等。
   • 如果有证据表明回迁合同的变更未经您同意或存在欺诈、胁迫等情形，这些证据将对您后续维权至关重要。

3. 与拆迁方或开发商协商：

   • 在收集了足够证据后，您可以尝试与拆迁方或开发商进行协商，要求他们解释回迁合同变更的原因，并寻求恢复原拆迁协议中的权益分配或达成新的合理协议。
   • 协商过程中，保持冷静和理性，明确表达您的诉求和依据，争取达成双方都能接受的解决方案。

4. 寻求法律途径解决：

   • 如果协商无果，您可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。这包括向当地房地产管理部门投诉、申请行政复议或提起行政诉讼等。
   • 在提起诉讼前，建议您咨询专业律师（即我本人），对案件进行全面评估，制定合适的诉讼策略，并准备好充分的证据材料。

5. 办理相关证照：

   • 在问题得到解决后，即回迁合同的权益分配得到明确或恢复后，您可以根据新的合同或协议来办理相关的证照手续。
   • 这可能包括房产证、土地使用证等，具体办理流程和所需材料可能因地区而异，建议您咨询当地相关部门或机构以获取准确信息。

额外建议：在整个过程中，保持与家庭成员的沟通至关重要。如果回迁合同的变更涉及到家庭内部的权益分配问题，那么与家庭成员进行坦诚的沟通并寻求共识是解决问题的关键。同时，也要注意保护自己的合法权益，避免在协商或诉讼过程中受到不必要的损失。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。