当施工合同书与工程质量保修书的保修期不一致时，应首先检查合同中有无特别规定；若无，则依据法律法规的强制性规定与行业标准，通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式解决，并优先保障法定最低保修期限的执行。以下是详细分析：
一、法律依据与合同效力的确定
法定最低保修期限：
- 根据《建设工程质量管理条例》第四十条，各类建设工程均有明确的最低保修期限。例如，屋面防水工程、有防水要求的卫生间、房间和外墙面的防渗漏为5年；电气管线、给排水管道、设备安装和装修工程为2年等。这些规定属于强制性标准，当事人不能通过约定排除或降低其适用。
合同约定的效力：
- 如果合同中约定的质保期高于法定最低标准，且不违反法律法规的强制性规定，同时确为双方真实意思表示，则该约定有效，应按照合同约定的质保期执行。
- 如果合同中约定的质保期低于法定最低标准，则该约定无效，应按照法定最低质保期来确定工程的质保期限。
二、处理保修期不一致的具体方法
检查合同条款：
- 首先，应仔细审查施工合同书和工程质量保修书，特别是关于保修期限的约定，以确定是否存在模糊、遗漏或矛盾之处。如果合同中有关于保修期不一致时的处理规定，则按合同规定的程序执行。
友好协商：
- 在无合同条款或条款不明确的情况下，双方应通过友好协商解决。可以重新明确质保期的具体期限，并签订补充协议。补充协议与原合同具有同等法律效力，是解决保修期不一致问题的有效方式。
考虑设计变更或施工条件变化：
- 在施工过程中，由于设计变更或施工条件的变化，可能导致原定的保修期限不再适用。此时，双方应根据实际情况重新协商确定保修期限，并签订补充协议。
寻求第三方调解：
- 若协商不成，可寻求第三方调解机构的帮助，如行业协会、建设工程纠纷调解中心等。这些机构具备专业知识和经验，能够公正、客观地分析问题并提出解决方案。调解成功后，需签订调解协议明确权利义务。
仲裁或诉讼：
- 如调解仍无法解决纠纷，当事人可根据合同中的仲裁条款或事后达成的仲裁协议向仲裁机构申请仲裁，或直接向人民法院提起诉讼（若合同无仲裁条款且未达成仲裁协议）。在仲裁或诉讼过程中，当事人需提供充分证据支持自己的主张，法院或仲裁机构将依法作出裁决。
三、预防保修期纠纷的建议
- 详细审查合同条款：在签订合同前，应详细审查合同条款，特别是关于质保期的约定，确保其清晰、明确且符合法律法规要求。
- 充分讨论并达成一致意见：双方应对质保期进行充分讨论并达成一致意见，避免后续产生不必要的纠纷。
- 咨询专业律师：在签订合同或处理保修期纠纷时，建议咨询专业律师的意见和帮助，以确保合同的合法性和有效性，并更好地维护自己的合法权益。
四、举例说明
假设某施工合同中约定的屋面防水工程保修期为3年，而工程质量保修书中约定的保修期为5年。此时，由于5年符合《建设工程质量管理条例》规定的法定最低保修期限，且高于合同约定的3年，因此应以工程质量保修书中约定的5年为准。如果合同中约定的保修期低于法定最低标准，如电气管线、给排水管道、设备安装和装修工程合同约定为1年，则该约定无效，应以法定的2年为准。
综上所述，处理施工合同书与工程质量保修书保修期不一致的问题时，应综合考虑合同约定、法律法规、行业标准及实际情况，通过协商、调解、仲裁或诉讼等途径妥善解决，并确保法定最低保修期限得到严格执行。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。