在拆迁安置房协议是甲方委托三方与您签订的情况下，若您对协议有异议，起诉对象需根据具体情况来确定。以下是从不同角度进行的分析：
合同相对性原则：
- 根据合同法的相关规定，合同具有相对性，即合同的权利义务主要约束合同双方当事人。在此情况下，若您认为协议内容存在违法、不公平或未履行等情形，且该协议直接约束您与三方（受甲方委托签订协议的主体），则您通常应起诉该三方，要求其承担相应的法律责任。
委托关系的影响：
- 然而，若甲方与三方之间存在明确的委托关系，且三方在签订协议时明确表明了其受甲方委托的身份，同时您也知晓这一委托关系，那么根据法律规定，受托人（三方）在委托人（甲方）授权范围内所实施的行为，其法律后果应由委托人（甲方）承担。在此情形下，若您对协议有异议，且认为该异议与甲方的行为或决策直接相关，您也可以考虑直接起诉甲方。
实际履行情况：
- 除了考虑合同相对性和委托关系外，还需关注协议的实际履行情况。若协议签订后，实际履行过程中主要由甲方与您进行沟通、协调或支付款项等，且三方在履行过程中未发挥实质性作用，那么您起诉甲方可能更为合适。反之，若三方在协议履行过程中扮演了重要角色，且您的异议主要针对三方的行为或决策，则起诉三方可能更为恰当。
法律建议：
- 在决定起诉对象前，建议您先仔细审查协议内容，明确异议的具体事项和理由。同时，收集相关证据，如协议文本、沟通记录、支付凭证等，以支持您的主张。
- 若您对法律程序不熟悉或担心自身权益无法得到充分保障，建议咨询专业律师（即向我咨询），以便更准确地判断起诉对象并制定有效的诉讼策略。
综上所述，起诉对象的选择需根据合同相对性原则、委托关系、实际履行情况以及您的具体异议事项和理由来综合判断。若您对此仍有疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。