经济开发区企业拿地后厂房出租是否合法，需根据具体情况判断，主要涉及土地用途、规划许可及租赁合同效力等核心问题。以下从不同角度详细分析：

1. 土地用途与规划许可

• 合法情形：若企业通过合法出让或划拨方式取得土地使用权，且土地用途明确为工业用地（或符合规划的商业、仓储等用途），并已取得《建设用地规划许可证》《建设工程规划许可证》等法定文件，则厂房建设及后续出租行为通常合法。
• 违法情形：若土地用途为住宅、农业等非工业用途，或企业未取得规划许可擅自改变土地用途（如将工业用地用于商业出租），则出租行为可能因违反《土地管理法》《城乡规划法》被认定为无效，甚至面临行政处罚（如罚款、责令限期改正）。

2. 租赁合同效力

• 有效合同：若厂房符合规划且企业有权出租（如土地使用权人或经授权的承租人），租赁合同内容合法（如明确租金、期限、用途等），则合同有效，双方需按约履行。
• 无效合同：若厂房属于违法建筑（如未取得建设工程规划许可证），或租赁用途违反法律强制性规定（如将厂房用于危险化学品生产但未取得安全许可），则合同可能因违反《民法典》第153条被认定为无效，出租方需返还租金并赔偿损失。

3. 特殊区域限制

• 经济开发区政策：部分经济开发区对厂房出租有额外限制（如需经管委会备案、限制转租对象等）。若企业未履行相关程序，可能面临行政约束（如限制享受税收优惠），但不一定直接导致租赁合同无效。
• 产业准入要求：若开发区对入驻企业有产业类型限制（如仅允许高新技术企业），而承租方不符合要求，可能影响合同履行（如出租方需承担违约责任），但不影响合同效力。

4. 实务建议

• 出租方：
  1. 确认土地用途与规划许可，确保厂房合法性；
  2. 在租赁合同中明确约定用途、违约责任等条款；
  3. 必要时向开发区管委会备案或报批。
• 承租方：
  1. 核查厂房权属证明及规划文件；
  2. 确认租赁用途符合土地规划及开发区政策；
  3. 要求出租方提供合法出租的书面承诺。

若您涉及具体案件，建议提供土地出让合同、规划许可文件、租赁合同等材料，以便进一步分析法律风险。