企业将租来的厂房二次出租是否合法，需视具体情况而定。以下从不同角度为您详细分析：
一、合法转租的情形
取得原出租人同意：
- 根据《中华人民共和国民法典》第七百一十六条：“承租人经出租人同意，可以将租赁物转租给第三人。承租人转租的，承租人与出租人之间的租赁合同继续有效；第三人造成租赁物损失的，承租人应当赔偿损失。承租人未经出租人同意转租的，出租人可以解除合同。”
- 解释：如果企业在租赁厂房时，已经取得了原出租人的书面同意，那么企业有权将厂房转租给第三方。这种情况下，转租行为是合法的，且原租赁合同继续有效。
原租赁合同中明确约定允许转租：
- 如果原租赁合同中已经明确约定了承租人（即企业）有权将租赁物转租给第三方，那么企业无需再取得原出租人的额外同意，即可直接进行转租。
二、非法转租的情形及后果
未经原出租人同意擅自转租：
- 如果企业未经原出租人同意，擅自将租赁的厂房转租给第三方，那么这种转租行为是违法的。
- 后果：原出租人有权解除与企业的租赁合同，并要求企业承担违约责任。同时，如果因转租行为给原出租人造成损失的，企业还需承担赔偿责任。
转租期限超过原租赁期限：
- 即使企业取得了原出租人的同意进行转租，但如果转租的期限超过了原租赁合同的期限，那么超出部分的转租也是无效的。
- 后果：在超出原租赁期限的部分，原出租人有权要求第三方返还租赁物，并可能要求企业承担相应的违约责任。
三、实际操作建议
审查原租赁合同：
- 在考虑转租前，企业应仔细审查原租赁合同中的相关条款，特别是关于转租的约定。如果合同中明确禁止转租或未提及转租事宜，企业应事先与原出租人进行沟通并取得书面同意。
签订转租合同：
- 在取得原出租人同意后，企业应与第三方签订详细的转租合同，明确双方的权利和义务。转租合同的内容应与原租赁合同相衔接，并确保不违反法律法规的强制性规定。
及时办理相关手续：
- 根据当地法律法规的要求，企业可能还需要向相关部门办理转租备案等手续。企业应确保及时办理这些手续，以避免因手续不全而引发的法律风险。
总结来说，企业将租来的厂房二次出租是否合法，关键在于是否取得了原出租人的同意以及是否遵守了原租赁合同中的相关约定。如果您在转租过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。