结论：合同到期后，新合同将工作制度从三班倒改为两班倒，这一变更是否合理，需从多个角度进行分析，包括劳动合同变更的合法性、双方协商一致的原则以及可能涉及的劳动权益影响等。
分析：
劳动合同变更的合法性：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同的变更应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致的原则。这意味着，如果用人单位希望变更劳动合同中的工作制度（如从三班倒改为两班倒），必须与劳动者进行协商，并达成一致意见。
- 如果新合同中的工作制度变更未经劳动者同意，或者变更内容违反了法律法规的强制性规定（如劳动时间、休息休假等），则该变更可能被视为无效。
双方协商一致的原则：
- 在劳动合同变更过程中，双方协商一致是核心原则。用人单位应当就变更内容与劳动者进行充分沟通，解释变更的原因和可能带来的影响，并听取劳动者的意见和建议。
- 如果劳动者对变更内容有异议，用人单位应当尊重劳动者的选择，不得强迫劳动者接受变更。在这种情况下，双方可以继续协商，或者维持原劳动合同的效力。
可能涉及的劳动权益影响：
- 工作制度的变更可能直接影响劳动者的劳动权益，如工作时间、休息休假、工资报酬等。因此，在变更工作制度时，用人单位应当充分考虑这些因素，确保变更不会损害劳动者的合法权益。
- 例如，如果新合同中的两班倒制度导致劳动者的工作时间增加或休息时间减少，用人单位可能需要支付加班费或安排补休等补偿措施。
建议：
- 对于劳动者：如果新合同中的工作制度变更未经你同意，或者你认为变更内容损害了你的合法权益，你可以与用人单位进行协商，要求维持原劳动合同的效力或就变更内容进行进一步谈判。如果协商无果，你可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 对于用人单位：在变更劳动合同中的工作制度时，务必遵循合法、公平、平等自愿、协商一致的原则。与劳动者进行充分沟通，解释变更的原因和可能带来的影响，并听取劳动者的意见和建议。确保变更内容不会损害劳动者的合法权益，以维护良好的劳动关系。
后续行动：
- 如果你对工作制度变更的具体内容或影响有疑问，或者需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。我将根据你的具体情况提供详细的法律建议和指导。