针对您提出的“公司违法调岗后员工旷工三天应如何处理”的问题，这实际上涉及两个层面的内容：一是公司违法调岗的问题，二是员工旷工三天的处理。不过，基于您当前的问题焦点，我将主要围绕“员工旷工三天”这一行为，在公司可能存在的违法调岗背景下，给出一般性的处理建议及法律依据。
一、员工旷工三天的处理原则
无论公司是否存在违法调岗的情况，员工旷工三天都是违反劳动纪律或公司规章制度的行为。公司应依据其合法有效的内部规章制度及相关法律法规来执行处理，同时确保处理方式的合法性、公正性和合理性。
二、具体处理方式及步骤
调查核实与沟通了解：
- 公司应首先调查核实员工的旷工事实，确认旷工的具体天数。
- 与员工进行沟通，了解其旷工的原因。若员工因公司违法调岗而旷工，公司应重视员工的反馈，并考虑调岗的合法性及合理性。
依据规章制度处理（假设调岗合法）：
- 若公司调岗行为合法，员工旷工三天则属于严重违反公司规章制度的行为。
- 公司可根据内部规章制度，对员工采取警告、记过、扣除相应工资、影响绩效评估等处理措施。
- 若员工旷工行为给公司造成经济损失，公司还有权要求员工承担赔偿责任，但赔偿方式和金额需合理且符合法律法规。
单方面解除劳动合同（极端情况）：
- 若员工旷工行为被认定为严重违反公司规章制度，且公司规章制度制定程序合法、向员工公示过，公司有权单方面解除劳动合同。
- 但需注意，若公司调岗行为本身违法，员工旷工可能被视为对违法调岗的合理反抗，此时公司单方面解除劳动合同可能面临法律风险。
考虑调岗合法性对处理的影响：
- 若公司调岗行为违法，员工旷工三天虽仍违反劳动纪律，但公司在处理时应更加谨慎。
- 公司应首先纠正违法的调岗行为，与员工协商解决调岗问题，而非直接对旷工行为进行严厉处理。
- 若员工因公司违法调岗而提出离职或要求赔偿，公司应依法处理，避免引发劳动争议。
三、法律依据
- 《中华人民共和国劳动法》及《中华人民共和国劳动合同法》：
- 这两部法律均规定了劳动者严重违反用人单位规章制度的，用人单位可以解除劳动合同。但同时也强调了用人单位规章制度的合法性及制定程序的合法性。
- 若公司调岗行为违法，员工有权拒绝并可能因此旷工，此时公司不能简单依据旷工行为解除劳动合同。
四、建议
公司应确保调岗行为的合法性：
- 在进行调岗前，公司应充分评估调岗的合法性及合理性，避免违法调岗引发劳动争议。
加强与员工的沟通：
- 在处理旷工行为时，公司应注重与员工进行沟通和协商，了解员工旷工的真实原因，尽量通过和解的方式解决问题。
依法处理劳动争议：
- 若员工对公司的处理结果有异议，公司应引导员工通过合法途径维护自己的权益，如申请劳动仲裁或提起诉讼等。
综上所述，对于员工旷工三天的处理，公司应首先确保调岗行为的合法性，再依据内部规章制度及相关法律法规进行公正、合理的处理。同时，加强与员工的沟通和教育，提高员工对劳动纪律的认识和遵守意识，是预防旷工行为、维护良好工作秩序的重要措施。