结论：公司不能在您工伤未愈的情况下，擅自将您的工资按请假来计算。这是不合法的，您有权要求公司按照工伤的相关规定来支付您的工资。
法律背景与解释：
工伤期间的工资支付规定：
- 根据《工伤保险条例》的相关规定，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这意味着，在您工伤治疗期间，公司应当按照您原来的工资标准来支付您的工资，而不是按请假来计算。
公司的违法行为及后果：
- 如果公司擅自将您的工资按请假来计算，这违反了《工伤保险条例》的规定，您有权向公司提出异议，并要求公司按照法律规定支付您的工资。
- 如果公司拒绝改正，您可以向当地的劳动保障监察部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
法律建议：
与公司沟通：
- 首先，我建议您与公司的人力资源部门或相关负责人进行沟通，明确告知他们您的工伤情况以及相关的法律规定，要求他们按照法律规定支付您的工资。
收集证据：
- 在沟通过程中，建议您收集好相关的证据，如工伤认定书、医疗证明、工资条等，以备不时之需。这些证据将有助于您在后续的维权过程中证明自己的权益。
寻求法律援助：
- 如果公司拒绝改正，或者您对如何维权感到困惑，您可以向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议和帮助。
可能的法律后果：
- 如果公司违反了《工伤保险条例》的规定，未按照法律规定支付您的工资，劳动保障监察部门有权对公司进行处罚，并要求公司补发您的工资。
- 在极端情况下，如果公司长期拖欠或拒不支付您的工资，您还可以考虑通过法律途径来追究公司的法律责任。
进一步思考：
- 在处理此类问题时，除了关注工资支付问题外，您还可以关注自己的工伤认定和伤残等级评定情况。这些将直接影响到您后续的工伤赔偿和福利待遇。
- 同时，建议您在工伤治疗期间保持与公司的良好沟通，及时了解公司的相关政策和规定，以便更好地维护自己的权益。
总之，公司不能在您工伤未愈的情况下擅自将您的工资按请假来计算。您有权要求公司按照工伤的相关规定来支付您的工资，并在必要时寻求法律援助来维护自己的合法权益。如果您有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。